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兰州市公共资源交易中心共设9个内设机构：(一)办公室负责政务、事务的综合协调工作;负责接待、信访和应急管理工作;负责财务管理工作。(二)纪检监察室负责中心纪律检查工作，负责中心、党风廉政建设和反腐败工作，负责调查处理各处室负责人及工作人员违反法律、法规、党纪党规、政策的行为。 (三)市场服务处负责研究起草交易活动的规章制度;负责综合评标专家的征集、评定、更新和专家库建设;负责维护交易市场的正常运行;承担交易活动档案管理及数据统计、分析工作。(四)技术信息处负责市级公共资源交易网络平台、诚信平台、数据系统的建设、管理和维护;负责收集、发布各类交易信息;指导县、区公共资源交易网络平台的建设、运行和管理。(五)评审和客户服务处负责各类交易的评审工作;负责各类交易活动的时间、场地安排;负责评标专家的随机抽取通知工作;负责各类交易活动的开标组织服务和联络工作。(六)工程建设处负责各类工程建设项目交易的组织实施和服务。(七)政府采购处负责各类政府采购项目交易的组织实施和服务。(八)国土资源交易处负责国土资源项目交易的组织实施和服务。(九)监督处负责对各类公共资源进场交易活动组织实施情况的内部监督;协助有关部门调查处理公共资源交易活动中出现的违法违纪问题。