2002年11月29日，海南省环境科学研究院(海南省环境监测中心站)在原海南省环境科学研究所(组建于1990年)和原海南省环境监测中心站(组建于1974年)的基础上合并组建。她是海南省国土环境资源厅直属的公益性科学技术事业单位，为国家一级环境监测站，也是我省唯一的省级环境科学专业研究机构。全院设置了办公室、总工室、综合室、大气监测室、水质监测室、中心实验室、生态监测室、研究规划室、统计信息室、国际合作中心、固体废物管理中心、环境影响评价中心、清洁生产审核中心等13个科室。