中国科学院新疆生态与地理研究所(以下简称新疆生地所)成立于1998年7月7日，由中国科学院新疆生物土壤沙漠研究所(1961年成立)和中国科学院新疆地理研究所(1965年成立)合并而成。2016年，根据院“率先行动”计划和相关部署，完成了特色研究所建设的年度任务。研究所制定了“一三五”规划，即面向国际干旱区生态、环境、资源领域科技前沿，面向国家“丝绸之路经济带”建设重大需求，面向新疆社会稳定与长治久安主战场，立足新疆，面向中亚，辐射世界干旱区，重点开展“丝绸之路经济带”生态与环境监测和评估、干旱区水土资源利用与生态安全、新疆和中亚矿产探测与环境治理、干旱区战略生物资源可持续利用、新疆农牧民增收和区域发展等研究。