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广东省微生物研究所前身为中科院中南真菌研究室，于1964年5月19日经国家科委批准成立，1972年改为现名，隶属于广东省科学院。依托研究所，1999年广东省微生物分析检测中心经广东省编办批准成立。现有员工284人，在读博士和硕士研究生48人，在站博士后7人。其中专业技术人员205人，博士55人，硕士67人。研究员27人，副研究员32人。建成由中国工程院院士、广东省科技领军人才、国家优秀青年基金获得者等为领军科学家的六大研究中心，在微生物应用基础研究、行业共性关键技创新及科技服务、微生物高技术成果转移转化方面，研究所己成为国内领军科研机构。