按照侧链,可以将20种常见氨基酸分为亚氨型基酸(Pro)、含醇氨基酸(Ser,Thr)、碱性侧链氨基酸(Lys,Arg)、含硫氨基酸(Cys,Met)、芳香族氨基酸(Phe,Tyr,Trp,His)、酰胺或羧基侧链氨基酸(Asp,Glu,Asn,Gln)以及脂肪族氨基酸(Ala,Gly,Val,Leu,Ile,)这几类。
在多肽化学合成中,合成是否可以成功,氨基酸的保护起到至关重要的作用。由于常见的20中氨基酸中大多数均带有活性侧链,需要被保护。对于保护基而言,通常要求它们在合成过程中稳定,没有副反应,完成合成以后能够将它们完全定量的脱除。
Thr,Trp,Tyr,Gln,Arg,Ser,Cys,Asp这些均为合成中需要进行保护的氨基酸,而吲哚,咪唑,酰胺基,胍基,巯基,氨基,羟基,羧基等这些则为需要进行保护的基团。当中Trp也可以不需要保护,因为吲哚有相对比较稳定的性质,在一些特殊的情况下,如Thr,Tyr,Asn,Gln这些氨基酸也可以不需要保护。
氨基酸侧链具有非常多的保护基团,有多种不同的保护基在同一个侧链上,能够在不同的条件下选择性的脱除,这点对于环肽以及多肽的修饰的意义很重要。并且侧链保护基密切关联选择的合成方法,固相和液相不同,在固相中,FMOC与BOC也有不同的策略。在某种意义上,灵活运用与搭配氨基酸保护基,即为多肽化学。
Boc,Fmoc,Trt,Dde,Allyl为LysZ常见的保护基,这为环肽的固相合成提供了很多正交的保护策略。
Otbu,OBzl,OMe,OAll,OFm为AspZ常见的保护基,这同样为环肽的固相合成提供了很多正交的保护策略。
Trt,Acm,Mob为Cys三种Z常见的保护基,二硫键多肽的合成可以通过这三个保护基来完成。
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