dna SOLiD测序技术

手工测序以及自动测序均属于DNA序列测定，手工测序可分为maxam-gilbert化学降解法与sanger双脱氧链终止法，事实上，目前dna序列分析的主流是自动测序。373型、377型、310型、3700和3100型等多种型号DNA测序仪均已经被美国pe abi公司生产出来了，在这几款DNA测序仪中，临床检测实验室使用Z多的一种型号要属310型。

SOLiD测序技术

由哈佛大学 Church 研究小组成员Shendure等Z初发明SOLiD测序技术。

1、首先对DNA文库进行制备，片段文库以及配对末端文库这两种测序文库SOLiD技术都支持。打断待测的DNA分子，并且将接头加在两端，那么就会使片段文库能够组成。而对末端文库进行配对就是首先打断DNA分子，将internal接头和EcoP15 酶切位点加到中间以后进行环化，之后使用EcoP15进行酶切，使得各有27bp的碱基位于接头的两端。Z后将接头加在两端，使得文库构成，在拷贝数的分析、结构重排、SNP分析、全基因组测序等相关领域非常适合应用。

2、第二个阶段相同于54焦磷酸测序法，将磁珠等反应元件加入，进行emPCR 平行扩增，磁珠只有1μm是不同点。在连接测序中，8个碱基的八聚体单链荧光探针为底物，四种不同颜色的荧光染料分别标记于5′末端。

3、有五轮连接反应包含于一次测序中，每轮连接反应首先在引物上由3个碱基“n”介导连接八聚体，测序仪对荧光染料信号进行记录，之后将碱基“z”断裂掉，准备对下一个八聚体进行连接，一次循环后，重置引物，进行第二轮连接反应，和前一轮反应相比较，位置错开一位，如此，第1、2位有两次连接引物上的每个碱基，使得测序误差得到显著的减小。

DNA测序方法的飞速发展除了使人类的全基因组序列为我们所知晓，而且还使得我们充分掌握了小麦、水稻、家蚕以及很多细菌。此时，科学家们的新目标也就变成了对一段序列所代表的生物学意义的探明。用于编码基因仅仅只有1.5%存在于核苷酸组成的庞大序列中，除此以外，扮演调控基因表达的角色有少许，其中功能未知的“垃圾DNA”占绝大部分，这一发现是科学家通过分析人类基因组序列获得的。由表面可知，人与人之间有着缤纷复杂的不同之处，然而，深入到DNA水平上，却仅仅存在0.1%基因编码序列上的不同。大多数时候，人与人之间在一条序列上的差异只有一个核苷酸，科学家将这种现象命名为单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，简称SNPs）。

在DNA测序商业化的浪潮下，完成5个以上有重大经济价值的基因或蛋白的转化应用、约500个新的功能基因的发现，10000种微生物、100种动植物基因组测序等目标在我国《生物产业发展“十二五”规划》中被提出。根据30-50万元为微生物进行“基因组完成图”测序的大致费用而言，千亿元级别为DNA测序带来的市场容量，其还只是DNA测序商业应用市场的冰山一角。