为您推荐:
仪器网 DNA测序仪 dna测序指标和技术路线
产品导购地图

dna测序指标和技术路线

推荐访问 dna测序问题与解答以及第三代测序技术效果DNA模板、困难模板以及机器对测序质量的影响纯化对测序质量的影响引物对测序质量的影响双脱氧链末端终止法改进和特点

手工测序以及自动测序均属于DNA序列测定,手工测序可分为maxam-gilbert化学降解法与sanger双脱氧链终止法,事实上,目前dna序列分析的主流是自动测序。373型、377型、310型、3700和3100型等多种型号DNA测序仪均已经被美国pe abi公司生产出来了,在这几款DNA测序仪中,临床检测实验室使用Z多的一种型号要属310型。


测序指标

测序深度

测序深度为对测序量进行评价的指标之一,是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,测序深度与基因组覆盖度成正比。

测序的个体,如果Mate-Pair或者双末端方案被采用,当有高于50X~100X的测序深度时,都能够保证住测序错误率控制以及基因组覆盖度,才可以使后续序列更容易与极ng准地组装成染色体。


4.jpg


覆盖度

测序得到的碱基覆盖基因组的比例,即是测序覆盖度。对测序随机性进行反映的指标之一是测序覆盖度,能够通过Lander-Waterman Model(1988)来对测序深度与覆盖度之间的关系进行确定。如果达到5X的深度,那么就能够覆盖超过99.4%的基因组。


技术路线

对基因组DNA进行提取,之后后随机打断,所需长度的DNA片段(0.2~5Kb)通过电泳进行回收,将接头加上,进行DNA簇(Cluster)制,Z后,测序插入片段使用Mate-Pair(SOLiD)或者Paired-End(Solexa)的方法。之后Contig通过测得的序列组装而成,Scaffold再通过Paired-End的距离进一步组装,进而能够将染色体等组装成功。测序深度与覆盖度、测序质量等决定了组装效果。SOAPdenovo、Trimity、Abyss等为常用的组装。


在业内,DNA测序有着高贵的出身,其将碱基序列这一基因密码破解,融合了IT技术与基因组学,将生物信息学这一新兴学科开创和发展了出来。传统的生物学技术被以生物信息学为代表的基因技术彻底颠覆了,对生命科学未来发展潮流起到引ling作用,在YL健康、环境保护、新能源、新材料、现代农业等热门领域以它为代表的基因工程得到了广泛地应用。


在DNA测序商业化的浪潮下,完成5个以上有重大经济价值的基因或蛋白的转化应用、约500个新的功能基因的发现,10000种微生物、100种动植物基因组测序等目标在我国《生物产业发展“十二五”规划》中被提出。根据30-50万元为微生物进行“基因组完成图”测序的大致费用而言,千亿元级别为DNA测序带来的市场容量,其还只是DNA测序商业应用市场的冰山一角。


2005-09-11 浏览次数:1351次
本文来源:https://www.yiqi.com/daogou/detail_3907.html
热门标签: dna测序问题与解答以及第三代测序技术效果双脱氧链末端终止法改进和特点
延伸阅读
同类型导购:

DNA测序仪产品导购

DNA测序仪产品资料

DNA测序仪产品问答

DNA测序仪产品厂家

最新资讯

看过该文章的人还看了以下文章

官方微信

仪器网微信服务号

扫码获取最新信息


仪器网官方订阅号

扫码获取最新信息

在线客服

咨询客服

在线客服
工作日:  9:00-18:00
联系客服 企业专属客服
电话客服:  400-822-6768
工作日:  9:00-18:00
订阅商机

仪采招微信公众号

采购信息一键获取海量商机轻松掌控