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Mitrionics携手SGI展出开源加速生物信息程序

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【导读】23日,Mitrionics;SoftwareAccelerationPlatform及MitrionVirtualProcessor的发展商Mitrionics;AB与SGI&a...

23日,Mitrionics;SoftwareAccelerationPlatform及MitrionVirtualProcessor的发展商Mitrionics;AB与SGI®在第十五届分子生物学智能系统国际会议(ISMB)及第六届欧洲计算生物学会议(ECCB)上展出其最新开源软件技术──FPGA加速生物信息程序。

在2007年7月20至25日奥地利维也纳举行的会议期间,Mitrionics将在摊位内展出MitrionDevelopmentPlatform、MitrionVirtualProcessor和最新推出的Mitrion-acceleratedNCBIBLAST-n生物信息程序。

MitrionAcceleratedNCBIBLAST结合了三大卓越组合,包括:Xilinx省电强力的FPGAs、SGI®Altix®服务器的超快内存副系统及MitrionVirtualProcessor,其运作速度远胜其它产品。在单一FPGA上持续运作的速度,比利用2.8GHz双核心AMDOpteron处理器的8220SE.(1)单核运作快60倍。

之外,2007年生物信息开源会议(BOSC2007)上,Mitrionics的高级软件工程师HenrikAbelsson介绍到,Mitrion加速BLAST开源程序及Mitrion-COpenBioProject如何能够利用开源程序进行发展,并对生物信息族群做出贡献。而HenrikAbelsson本人也是Mitrion-acceleratedBLAST程序的主要开发人员。

MitrionicsAB行政总裁AndersDellson表示:“Mitrionics的开源加速BLAST程序利用了SGI的RASC系统,并已正式在各处投入服务。合并方案为业界就纯正的处理性能及超低耗电量订立了全新基准,更能为全球研究所及制药公司的基因学研究带来实时好处。”

SGI科学发展经理MichaelBrown称,Mitrion加速BLAST-n利用SGIRASC生物信息器材,能使速度提升60倍以上。用户只需更改BLAST-n资源码的0.2%,便能取得这种效果。特别对于计算密度要求更到的程序,更能体现其有点。

而对于利用MitrionVirtualProcessor带来BLAST优化,分析人事认为,能进行大规模平衡处理的MitrionVirtualProcessor(MVP)是MitrionPlatform的核心所在,这也是全新加速Mitrion-BLAST的重要组成部分。
MVP及其相关软件全部由Mitrion-C编程语言开发,基于FPGAs语言写成,所以程序员无需掌握硬件设计技巧,也能轻松使用。

MitrionVirtualProcessor的结构独特,能因应运作程序而调教,发挥最佳性能,更可大幅减低发展FPGA加速软件的总成本。更重要的是,本处理器让整个超级计算机业界都能受惠于FPGA的程序加速技术。

SGI|InnovationforResults™简介

SGI(纳斯达克:SGIC)专门发展高性能计算机,在业内首屈一指,能提供一系列高性能服务器及储存方案,并其它业内尖端专业服务,又能支持客户应付复杂的密集信息工作流程,加快突破性的发现、创新及信息更新。

SGI方案协助客户解决计算机应用带来的问题,包括:透过药物研究提升生活水平、设计及生产更安全有效的汽车与飞机、研究全球气候、提供国土安全及国防所需科技,或协助企业管理大量信息等。

Mitrionics简介
Mitrionics,Inc.于2001年正式成立,是FPGA超级计算机的业内翘楚。FPGA超级计算机为近年新兴发展,能提升处理器能量,减少能源消耗,比计算机系统群组更胜一筹。

该公司的MitrionVirtualProcessor及MitrionSoftwareDevelopmentKit让客户能利用FPGA超级计算机技术,管理关键程序,而且符合成本效益,经济实惠。而MitrionPlatform更是个独一无二的FPGA程序方案,其设计减低了对电路设计技术的要求,令新兴市场内所有科学家与发展商都能享用FPGA超级计算机的优越性能。

Mitrionics与Cray、Nallatech及SiliconGraphics均已建立重要业务联系。


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2018-11-08 09:23:03
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