电泳仪通电进入工作状态后，禁止人体接触电极、电泳物及其它可能带电部分，也不能到电泳槽内取放东西。
仪器通电后，不要临时增加或拨除输出导线插头，以防短路现象发生。
不同介质支持物的电泳不要同时在同一电泳仪上进行，因为不同介质支持物的电阻值不同，电泳时所通过的电流量也不同，其泳动速度及泳至终点所需时间也不同。
在总电流不超过仪器额定电流时（Z大电流范围），可以多槽关联使用，但要注意不能超载，否则容易影响仪器寿命。
某些特殊情况下需检查仪器电泳输入情况时，允许在稳压状态下空载开机，但在稳流状态下必须先接好负载再开机，否则电压表指针将大幅度跳动，容易造成不必要的人为机器损坏。
使用过程中发现异常现象，如较大噪音、放电或异常气味，须立即切断电源，进行检修，以免发生意外事故。
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