合成生物学被称为将是又一次改变世界的机会,是当前产学研用炙手可热的领域。合成生物学的不断创新和发展,将给我们现有的生活带来颠覆性的改变。目前,合成生物学在医药、食品、农业、能源、材料、环境等方面都展现出了可观的应用前景。
合成生物学是生物学工程化高度交叉汇聚的学科,利用分子生物学、工程学、化学、数学、物理学、信息学等不同学科的知识,设计和建造新的生物学元件、模块、系统乃至细胞和生物个体,并出于应用目的改造现有的自然生物学系统。合成生物学采用“设计-构建-测量-学习”工程循环,来优化最 佳生物合成途径、构建细胞工厂或微生物工厂。
安捷伦众多产品线平台包括基因组学、色谱、质谱、微生物细胞分析及自动化产品等,可为合成生物学整个工程循环提供综合解决方案。
设计阶段:
合成生物学工程循环往往以待实现的功能目标作为研究出发点,例如合成特定化合物、构建特定生物调控通路或模块等,继而基于工程化策略选择生物元件,设计新的代谢途径或“基因电路”。
安捷伦基于 CRISPR 技术的解决方案可提供重要的基因编辑工具,提高基因编辑的准确性与编辑效率。
构建阶段:
基于设计的代谢模型及组装图谱,需要针对相关功能的基因元件在底盘生物中构建代谢途径。
安捷伦提供的各种分子生物学技术与工具可以帮助研究人员实现高效分子克隆与基因表达,包括化学合成的 CRISPR 向导 RNA,OLS 合成服务、SureVector 新一代克隆系统、QuikChange 突变技术、定向克隆产品、病毒表达系统等等。
测量阶段:
建立高通量检测平台,在底盘生物上对器件之间的组合进行测试,从基因、蛋白质、代谢物、调控网络及底盘细胞/微生物的层面上揭示组装构建的适配性及其对底盘细胞/微生物的影响,从而为工程组装优化循环提供理论依据。
安捷伦提供广泛的硬件与软件平台,覆盖从基因型、表型到细胞微生物检测,配以自动化、高通量的流程策略,为合成生物学提供了各个层面的测试方案。
图 1 .安捷伦多组学方案助力底盘生物设计的成功
学习阶段:
对于通过各种测试手段获得的大量实验结果,需要对信息进行提取和整合,以验证预设功能是否实现并对模型进行进一步优化。
安捷伦在硬件平台之外,提供了功能全面、简便易用的软件和生物信息学方案,为合成生物学的学习环节提供支持。
智能、高通量、自动化整合:
在合成生物学研究中,需要进行海量的工程化试错实验。合成生物学平台需要引进各类符合生产所需的智能装备、自动化设备,提升“设计-构建-测量-学习”循环的效率与通量。
安捷伦开发各种自动化、高通量平台与合成生物学各环节方案集成,打造高效整合方案。
图 2 .安捷伦打造合成生物学自动化整合方案展示
结 语
目前,合成生物学从研发到产业化,到最 终走向工业应用,仍然面临众多挑战。安捷伦愿意将已有的产品与更多外部平台连接, 与客户一起打造真正满足客户需求的合成生物学综合解决方案,共创合成生物学发展的新时代。
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