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广东省中药研究所(以下简称“中研所”)始建于1955年，前身是广东省中医药研究委员会和广东省中医药研究所。1986年加挂广东南药研究所牌子，时归广东省食品药品监督管理局管理。1998年与广东食品药品职业学院合并。1999年被省人民政府纳入69家省直属的全民所有制科研机构管理范围。2012年被划为公益三类事业单位。2016年随学院成建制划转广东省教育厅管理。曾下辖管理海南南药场(建于1959年，海南建省后移交海南省管理)和广东湛江南药实验场(建于1964年，1998年移交湛江市管理，研究所与其保持业务指导关系)，曾建有国家药品管理局中药材情报中心站和中药材杂志编辑部(1978年创刊，1998年移交给国家食品药品监督管理局中药材信息中心站管理)。2017年，引进社会力量参与投资运营。2019年被广东省科技厅认定为新型研发机构。