微生物鉴定的方法

与传统生化鉴定的鉴定方法相比，通过DNA测序对微生物进行鉴定要更加的先进。DNA测序不对菌种本身的特点依赖，任何菌种都能够使用这种方法。与传统生化鉴定的鉴定方法相比，更加的准确与快速。真菌26S/28SrDNA鉴定、真菌ITS鉴定和细菌16srDNA鉴定都属于微生物物种鉴定。通过大量实验优化的通用引物对于99%以上的微生物都适用，有超过95%的鉴定成功率。理化特性和形态特征是常规的鉴定内容。理化特性包含血清学反应、酶反应、各种代谢反应、碳氮源利用能力和营养类型等。形态特征包含培养特征以及显微形态。

分子生物学鉴定

从遗传进化角度阐明微生物种群之间的分类学关系就是应用分子生物学方法。该方法是微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。需要配备紫外控温分析系统、凝胶成像系统、电泳仪、高速冷冻离心机、PCR仪等先进仪还有TREEVIEW、CLUSTALX、BIOEDIT、DNAMAN序列分析软件，如此，在分子生物学实验室中才能够进行微生物菌种分类鉴定试验。丝状真菌的18S rDNA/ ITS1-5.8S-ITS2序列、酵母18S rDNA/26S rDNA（D1/D2）序列以及16S rDNA/16S-23S rDNA区间序列，能够通过核酸序列分析法对这些细菌进行分析并且能够得出科学的鉴定结果。

自动鉴定

BIOLOG鉴定系统是把微生物对不同碳源的利用情况作为基础，对测微生物的特征进行检测，从而使得与微生物种类相对应的数据库得以建立。根据软件把待测微生物和数据库参照对比，从而得出鉴定结果。美国FDA已经认可该系统，该系统已经在化妆品、临床、生物治理、农业微生物、海洋生物/水产品、制药、环保、食品和饮品等领域得到了广泛地应用。

API细菌鉴定

有15个鉴定系列包含在API鉴定系统里，该系统大概有1000种生化反应，已经能够鉴定600种以上的细菌。在鉴定过程中，能够根据细菌所属的类群群选择适当的生理生化鉴定系列，通过软件将待测细菌与数据库参照对比，得出鉴定结果。乳酸杆菌（Lactobacillus sp.）和相关细菌、芽孢杆菌（Bacillus sp.）、葡萄球菌属（Staphylococcus sp.）、微球菌属（Micrococcus sp.）可以通过API 50CH系列、API 20 E系列、API Staph系列进行鉴定。