生物质谱仪的分类

自从1886年早期质谱仪器常用的离子源被Goldstein发明出来，一直到1942年di一台单聚焦质谱仪商品化，质谱大体上处在理论发展阶段。在此以后，由于发展和完善的电离技术以及分析技术，使质谱非常快地在地质、空间研究、环境化学、有机化学、制药等多个领域得到应用。

分类

电喷雾电离与基质辅助激光解吸电离为生物质谱仪的主要的离子化方式。四极杆质量分析器为前者所采用，所构成的仪器叫做电喷雾（四极杆）质谱仪，后者质量分析器常用飞行时间，所构成的仪器叫做基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪。能够联用液相色谱、毛细管电泳等现代化的分离手段，从而使其在生命科学领域的应用范围，包括药物代谢、临床和法医学的应用等得到了非常大的拓展为ESI-MS的特点之一。

对盐和添加物有着比较高的耐受能力，并且有着较快的测样速度，能够简单地进行操作为MALDI-TOF-MS的特点。除此以外能够在生物大分子测定的质谱仪还有离子阱质谱和傅里叶变换离子回旋共振等得到应用。

液相色谱-电喷雾-四极杆飞行时间串联质谱仪和带有串联质谱功能的MALDI-TOF质谱仪为zui新上市的生物质谱仪，前者基于传统的电喷雾质谱仪，四极杆质量分析器为飞行时间质量分析器所替代，使仪器的分辨率、灵敏度和质量范围得到了大大的提高，后者是将源后降解模式或碰撞诱导解离模式加入到质谱中，从而有可能实现测序生物大分子。

微生物鉴定的应用：

通过每种细菌分离物的生物质谱能够使基于每种细菌惟一的肽模式或指纹图谱获得来对细菌进行鉴别。Hsu已经使用串联质谱对沙门菌 J进行了鉴定。因为在细菌体内，蛋白质有着比较高的含量。生物质谱在细菌属、种、株的鉴定方面常常得到使用。而串联质谱还可针对糖类或脂类的脂肪酸组成进行鉴定。除此以外，通过处理生物样本以后，串联质谱也能够从单细菌水平将病原菌及孢子发现和确定下来。分析特殊脂质成分就能够对样本中病原菌的活力和潜在感染加以了解。