S9.6单克隆抗体识别R环的基本结构

Wyatt专 题期刊

R环（R-loops）结构普遍存在于动态核酸中，在 DNA 复制和修复、染色质和转录调控及端粒维持中发挥着重要作用。DNA-RNA 杂交特异性 S9.6 单克隆抗体经常被用于识别 R-loops。本期刊中报告了游离 S9.6抗原结合片段（Fab）结合到13-bp杂合双链体的晶体结构，且证明了 S9.6 在面对结合杂交双链RNA和绝 对排斥双链DNA时表现出强大的选择性。S9.6通过其2′-羟基不对称识别两个连续RNA核苷酸的紧凑表位，并通过其主干磷酸和脱氧核糖基团不对称识别六个连续DNA核苷酸。识别主要由S9.6重链的芳香族和碱性残基介导，这些残基密切跟踪杂交小沟的曲率。这些发现揭示了S9.6识别R-环的分子基础，详细说明了其结合特异性，确定了一种新的杂交策略，为S9.6蛋白质工程提供了框架。