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土壤微生物做高通量 土壤dna浓度应该是多少

645182810a    2017-07-20    土壤核酸提取    浏览 636 次

精彩问答
kongxinzhu空 发布日期:2017-07-21
计算土壤微生物数量,常见的有两种方法,一种是传统的培养法,即平板法,将一定质量的土壤制成悬浮液,稀释后涂到培养基上,培养18-24h,在显微镜下找菌落数目,乘以稀释倍数,粗略估算细菌数量。但这种方法只能得到可培养的微生物数目,仅占土壤总细菌的1%,另外99%的微生物是不可培养的,用这种方法得到的值只是参考数值;
第二种方法是高通量测序的方法,提取土壤总DNA,通过测定土壤中所有DNA的碱基序列,与细菌的碱基序列数据库比对,得到细菌的名称(操作分类单位,OTU),根据序列的条数大概估算这类微生物所占的比例。但这种方法无法区分死亡的细菌和活着的细菌,也有一定的局限性。
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