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用测序的方法检测点突变可靠吗?

K45843K45843    2019-09-12    DNA测序仪/基因检测仪    浏览 442 次

用测序的方法检测点突变可靠吗?

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yangruyi2017 发布日期:2019-09-12 16:54:55

答:有的客户想用测序的方法检测点突变体,我认为该方法可靠性不高。主要有以下两个原因。首先,们并不清楚突变的序列与正常的序列的比例是多少。测序反应的信号强度直接与模板的量有关,如果突变的模板所占的比例很少,将直接作为背景噪音了,很难检测出来。只有当测序反应体系中正常的和突变的模板量比较接近时,才能较可靠地检测到突变体的存在。其次,在同一位置,不同碱基的信号强度一般是不一样的。这样即使突变的模板所占的比较较高时,也不一定能准确检测到突变的存在。另外,测序仪是设计用来测序正常的碱基序列的,软件在对扫描的结果进行处理时会尽量提高主峰而将背景信号尽量压低,以得到尽可能好的结果。因此,当某处出现双峰时,测序仪一般会认为信号弱的峰为背景信号,在处理过程中,将弱的峰进一步压低,这样根部不立于突变体的检测。因此认为,用测序的方法检测突变体的存在不是一个好的方法。

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