组学热点技术交流
10月20日,由赛默飞与ZG疾病预防控制ZX环境与健康相关产品安全所联合举办的《赛默飞世尔疾控系统组学技术交流会》在北京举行。
会议邀请了凯莱普上海事业部总监孔子青博士、ZG检验检疫科学研究院食品安全研究所副所长徐秀丽博士、ZG医学科学院基础医学研究所孙伟博士,以及来自ZG疾病预防控制ZX各研究所,国家食品安全风险评估ZX,北京市疾病预防控制ZX及各区疾病预防控制ZX的近百位专家和用户,共同对新冠病毒代谢流研究、蛋白组学、食品组学和环境暴露组学等当前与疾控系统密切相关的热点问题进行了深入探讨和技术交流。
代谢组在新冠与感染性疾病中的应用
凯莱普上海事业部总监孔子青博士
详细解读了由迪安凯莱普等合作发表在《Cell》上题为《Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera》的科研成果。作者通过分子层面研究病毒对人体机能的影响及轻症转重症的标志物,在赛默飞高分辨QE质谱上利用代谢组学技术分析了新冠病人的血清样本,共鉴定出941个代谢产物,其中204个特征改变的代谢产物与疾病严重相关,发现大量能量相关代谢物在普通和重症患者血清中显著下降,巨噬细胞、血小板和补体系统调节通路异常、肝脏解 毒功能受损等情况,解读“新冠病人为什么没有一点力气?”这一现象的原因。研究建立包含7个代谢物和22个蛋白质的评估模型,并对进一步研究做出展望。
基于orbitrap的环境暴露组学研究及解决方案
赛默飞LSMS小分子应用工程师史碧云
对暴露组学的概念和实验过程进行了展示和示例,并针对代谢组学相关的部分工作进行了基于Orbitrap平台的数据采集和分析介绍,包括数据采集的方法、数据处理的过程、结果解读和展示,对于数据库的组成、鉴定的步骤、归一化的方法、通路分析的结果等全流程解决方案进行了详细讲解和实例解读。
食品中未知有害物质的质谱发掘及检测技术
ZG检验检疫科学研究院食品安全研究所副所长许秀丽博士
报告对食品中未知有害物质谱发掘理论,食品中未知有害物的质谱发掘技术,食品中有害物的高选择性质谱检测技术做了详细描述与展望。本研究基于同类结构物质具有相同质谱裂解规律,筛选了可标识同类结构的质谱裂解标志物,建立‘逐类发掘’方法,提出了质谱裂解标志物的筛选原则,利用赛默飞高分辨高灵敏度的orbitrap质谱平台,筛选出52个质谱裂解标志物,利用orbitrap质谱的高分辨率能力,解决了同类结构未知化学性有害物的发掘难题,并在牛奶过度加热标志物发掘的实践案例中得到应用。
尿液蛋白组及其在疾病研究中的应用
ZG医学科学院基础医学研究所孙伟博士
从蛋白质组学角度回顾了尿液中蛋白质种类的发现和研究历程,以及尿液样本作为除血液样本之外,同样能够提供各种人体健康相关信息的重要人体生物样本,在尿液样本研究中质谱出现的必要性及高分辨Orbitrap的出现给尿液中蛋白研究带来了更多惊喜。通过2D-LC LTQ-Orbitrap技术,极大的提升了尿液中大分子蛋白种类的发现数量,并且通过创新性研究,发展ZX的3D-LC 高分辨质谱技术,可以从尿液中发现多达6085种蛋白。通过蛋白质组学技术,发现了肾脏病人和普通人的尿液蛋白差异,以及男女性别差异造成的尿液蛋白差异,对这些蛋白差异进行归一化分析,进一步揭示肾脏疾病和尿液蛋白的相关联系,以达到通过尿液蛋白的检测进行肾脏疾病的早期预警作用。
GC orbitrap 在代谢组学中的应用
赛默飞应用经理邢江涛
GCMS作为代谢组学不可或缺的技术手段,在近年来受到广泛关注。而非靶向研究策略的兴起则为传统GCMS提出了挑战。GC Orbitrap作为新兴的气质高分辨联用仪,凭借超高分辨率、优异的稳定性,以及全扫描分析即可获得与GCMSMS相当的灵敏度, 6个数量级的动态范围等特点,开始被研究学者青睐。截至目前,已有超过100篇的文献发表,涉及食品、环境、代谢组学等多个领域的靶向及非靶向分析。
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