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Naica™ Crystal数字PCR助力造血干细胞移植后嵌

艾普拜生物科技(苏州)有限公司    2020-11-24    荧光定量PCR    浏览 444 次

背景导读—何为嵌合状态的检测?

gusui和外周血干细胞移植是许多恶性和非恶性疾病的有效ZL方法。造血干细胞移植后,受体产生新的血细胞,这些血细胞在遗传上来自于供体DNA。确认新的造血系统来源于供体是临床复发监测的重要组成部分。一般采用血细胞基因型检测的方式,称为嵌合体分析。完全供体细胞嵌合状态意味着100%的血细胞来自供体,而混合或部分嵌合意味着受体细胞也存在。因此检测时需要分析受体在移植后的血液或gusui中供体和受体的基因型的各自比例。

法国苏黎世输血服务ZX实验室使用Stilla Technologies的Naica™ Crystal数字PCR系统进行双等位基因单核苷酸变异(SNV)检测,从而确定嵌合体状态。

嵌合体检测的两步策略

移植前:要想得到正确的移植后的检测结果,必须选择合适的标记物,苏黎世输血服务ZX实验室建立了一个由24种特定SNV分析组成的组合,用于寻找在单个样品分析中筛选供体和受体DNA的合适标记。

移植后:在临床上,嵌合体监测至少需要0.5%的等位基因敏感性。Naica™ Crystal 数字PCR仅使用5ng DNA,就达到了所需的0.5%的灵敏度。使用标准的20ng DNA进行检测可以使一个等位基因频率的可重复量化精度达到0.25%。(图2)

总结

Naica™ Crystal数字PCR在造血干细胞移植后嵌合状态检测方面的优势:

☑  可与建立的SNV嵌合体检测方法完全兼容。

☑  使用Naica™系统进行的标准测试可使等位基因频率检测灵敏度降至0.25%,远低于0.5%的临床限值要求。

☑  此次研究,使用了Naica™系统中的高通量Opal芯片,一次可检测48个样本,每个样本可进行3荧光通道读取,仅需较低的DNA输入量,即可实现更高的样品通量和谱系特异性嵌合体检测的能力。


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