奥密克戎变异株六个突变位点的鉴定-数字PCR来分型

我是Omicron，中文名奥密克戎病毒，来自南非的新变种，都听说了吧，如果你没听过我的名号，你可能就有点out了。

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各地都有我的身影，国内呢，我正在香港、深圳、苏州等地晃悠，人类给我总结的特点就是快，传播快呀~

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听说新冠自2019年末被发现至今已累计感染超4亿人，新冠达到1亿确诊时是在2021年1月，之后只用了7个月就达到2亿，而翻倍达到4亿则只用了6个月，特别是3亿到4亿只用了1个多月的时间。这主要归因于我奥密克戎变异株的高传染性和快速传播性。

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根据新冠病毒数据库GISAID目前共享的信息显示，我奥密克戎变异株的突变位点数量明显多于近2年流行的所有新冠病毒变异株，而最近的感染分析发现，奥密克戎毒株现有感染中也出现了进一步变异的分支亚型，带R346K变异的BA.1和BA.2。BA.1+ R346K亚型占现今奥密克戎序列的约40%，在新西兰、英国和美国这一比例则为35-60%。BA.2亚型占奥密克戎序列的约10%，其流行率正在上升，并且在丹麦、印度和南非已占主导地位。我和之前的新冠病毒相比已经改变得面目全非.

通过人们的研究，对不同分支亚型的治疗分析发现，同属奥密克戎的不同亚型对不同中和抗体的反应也并不相同。谢晓亮团队在《nature》的文章表明，奥密克戎RBD上的单个突变会影响不同类别抗体的有效性（该文章筛选了247种人类抗体，且将其分为6类）。例如，奥密克戎可利用突变K417N、G446S、E484A和Q439R逃逸A类至D类的抗体，这些抗体的表位与ACE2结合基序有重叠。Davide Corti团队在《nature》发表的文章也表明奥密克戎免疫逃逸能力或强于之前新冠病毒谱系，研究中测试的8种治疗性单克隆抗体中，大部分完全失去了对奥密克戎的中和活性，扩大筛选范围后，入选的36种中和抗体，只有6种对奥密克戎依然具有中和活性，而在29种靶向RBD特定区域（受体结合基序）的单克隆抗体中，有26种对奥密克戎的中和活性出现了显著下降。

这些结果都提示我们，未来对新冠病毒的分型将是一个非常重要的工作，不但会影响我们的疫情防控工作，也会影响到我们针对新冠肺炎治疗药物的研发和不同患者的针对性治疗。

我的秘密被暴露了，好像找到了方法对付我。

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让我看看是啥方法~

原来是naica®微滴芯片数字PCR一次快速鉴别Omicron新冠病毒变异株刺突（Spike）蛋白6个突变位点，并实现绝对定量，获得鉴定和监控。

应用亮点：

▶  6个核心突变位点快速检测。

▶ 可视化微滴溯源单个阳性微滴，确保结果真实可靠。

▶  阳性微滴定性分析，同时给出定值，便于监测监控。(翻译成中国话就是：检测位点多、灵敏、还能监控我~）

方法描述：

试剂：Omicron（奥密克戎）新冠病毒变异株鉴定试剂盒（珠海辉睿公司）

仪器：naica®微滴芯片数字PCR系统（北京深蓝云生物科技有限公司）

数据分析：

数字PCR通过阳性微滴直接判读阳性结果。

▲ 图1：阈值判读直观阳性位点扩增明确

这样奥密克戎很容易就分型了。

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新冠病毒已肆虐了2年多的时间，且仍处于不断变异过程中，随着人们对其认识更加深入，人们对其危害的认知也越来越清晰，各种后遗症的发现，各种新出现亚型不断挑战疫苗和治疗手段组成的防线。

我们是否应该针对病毒不同亚型展开更有针对性的治疗方案研究？

我们是否应该针对病毒不同亚型的感染特点采取更加有效的防控措施？

我们是否应该针对感染进行更精细化，更个人化的分析和治疗？