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生物拉曼光谱检测技术方案(三)丨拉曼光谱在微生物代谢研究中应用

来源:长春长光辰英生物科学仪器有限公司 更新时间:2024-03-21 16:15:11 阅读量:122
导读:辰英的微生物代谢检测平台将荧光原位杂交(FISH)技术与单细胞拉曼光谱技术相结合,可以实现对已知基因信息的目标微生物的代谢表型及功能分析,为深入理解功能菌的作用机制提供一种有力的新工具。

环境中存在大量尚无法培养获得的功能微生物,通过宏基因测序我们可知这些有目标菌的基因序列,但难以对其功能进行验证。

辰英的微生物代谢检测平台将荧光原位杂交(FISH)技术与单细胞拉曼光谱技术相结合,可以实现对已知基因信息的目标微生物的代谢表型及功能分析,为深入理解功能菌的作用机制提供一种有力的新工具。


应用案例


· 基于FISH-Raman的聚磷菌代谢分析

本研究利用荧光原位杂交技术(FISH)在污泥样品中,通过不同荧光探针指示各种属的菌;同时结合单细胞拉曼光谱技术(Raman),对聚磷菌Tetrasphaera中多聚磷、糖原和PHA等胞内代谢物进行原位分析,为深入了解的碳来源依赖的代谢及其对全球废水除磷的贡献提供洞察。

【文章链接:《ACS ES&T Water》丨聚磷菌Tetrasphaera在不同碳源下的除磷和聚合物的合成 (qq.com)


· 基于FISH-Raman的未培养古菌研究

本研究应用基于线性支持向量机的机器学习分类模型对9种古菌进行分类,准确率为88-100%,并通过单细胞分选及DNA测序分析验证了分类结果。此外,采用荧光原位杂交结合拉曼光谱技术(Fish-Raman),直接从海水中获取未培养古菌(MGⅡ)和细菌的拉曼光谱,表明MGⅡ可能具有不同于其他古菌的产生脂肪酸的能力。本研究为未培养微生物研究提供了一个新方法。

【文章链接:客户文章  | 《Analytical Chemistry》:基于单细胞拉曼分选的古菌研究新策略 (qq.com)


核心设备


· 激光共聚焦拉曼光谱仪P300

【产品介绍:P300 共聚焦拉曼光谱仪 (qq.com)

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END


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