高内涵相关实验设计
设备型号:
ImageXpress Micro XLS、ImageXpress Micro Confocal (Molecular Devices)。
实验目的:
获取细胞培养过程中的形态学图像、免疫荧光染色图像,用于分析细胞排列、标志物表达、脂质积累等指标。
应用场景:
IN Carta 软件(version 2.1)
参与的实验细节
核心功能:
基于深度学习的图像分割与量化分析,聚焦 VE-钙粘蛋白(VE-Cadherin)相关指标。
分析流程:
导入 MetaXpress 转换后的图像,利用 SINAP 模块预训练的细胞核深度学习网络(DCNN)分割 Hoechst 染色的细胞核区域。
训练两个专用 DCNN:一个分割 VE-Cadherin 染色的细胞连接网络(阳性区域),另一个分割连接间的细胞间隙(阴性区域)。
提取形态学、信号强度、位置和纹理描述,结合阴性区域掩码分析其他标志物的相关数据,排除小于 5 μm 或通道外的异常目标。
单向流与双向流下 HCAEC/HCASMC 共培养血管中 VE-Cadherin 的分布差异
通过 IN Carta 软件对 VE-Cadherin 信号的分割与分析,直观展示了单向流与双向流下 HCAEC/HCASMC 共培养血管中 VE-Cadherin 的分布差异——单向流组的 VE-Cadherin 连接更线性、均匀,双向流组连接更厚且模糊,这一结果直接来自软件对“阳性连接区域”和“阴性间隙区域”的精准分割量化。
血管收缩量化图与 VE-cadherin 染色图
上图为软件对 VE-Cadherin 总覆盖面积的量化结果,直接用于评估炎症因子处理后血管的收缩程度。说明单向流维持血管内皮完整性、双向流诱导内皮功能障碍。
ImageXpress HCS.ai 智能高内涵成像分析系统
关于美谷分子仪器
Molecular Devices 始创于上世纪 80 年代美国硅谷,并在全球设有多个代表处和子公司。2005 年,Molecular Devices 在上海设立了中国代表处,2010 年加入全球科学与技术的创新者丹纳赫集团,2011 年正式成立商务公司:美谷分子仪器 (上海) 有限公司。Molecular Devices 以持续创新、快速高效、高性能的产品及完善的售后服务著称业内,我们一直致力于为客户提供在生命科学研究、制药及生物治疗开发等领域蛋白和细胞生物学的创新性生物分析解决方案。
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