过去,科学家像“大海捞针”一样筛选菌株——人工肉眼挑菌效率低、重复率和成本高、漏检多,90%的时间浪费在重复劳动上,且低丰度“宝藏菌”常被错过!
自主研发的RAcolony高通量菌落智能筛菌系统是微生物界的"AI淘菌机":
? 火眼金睛:高分辨率微观成像+拉曼光谱技术,让重复菌落无可乘之机!
? 去重利器:AI智能去重,剔除85%以上重复菌株,直接点菌成金!
? 精准收割:机械臂自动挑取目标菌株,让筛菌不再辛苦!
RAcolony高通量菌落智能筛选系统
01
研究方法
1)样品:用18种肠道菌株构建模拟菌落平皿标准样本,每个平皿保证300个菌落左右。
2)菌落原位检测和去重:通过RAcolony软件一键式操作完成:① 宏观成像对全皿菌落精准定位;② 自动采集全皿菌落微观成像;③ 自动采集全皿菌落拉曼光谱;④采集同时进行智能化“去重”算法分析;⑤机械臂自动化精准挑取扩培,便于后续研究。
02
成果展示
Fig. 1 菌落微观图像。
a)混合样本中同一类菌株的图像表型;b) 混合样本中不同类菌株的图像表型。
微观成像“去重”
按去重后36/360的菌落挑取数,可成功捕获原始平皿85%以上物种(Fig. 1a-b和Fig. 3a-c)。
Fig. 2图像智能化算法分析、聚类、挑取结果。
a)18类肠道菌株20余项图像特征参数相似性聚类结果;b) 根据a)聚类分布,捕获混合样本18类菌的算法挑选分布;c) 物种覆盖率与挑取菌落数量的关系。
Fig. 3 菌落拉曼光谱及其信噪比。
a)全皿菌落拉曼光谱信噪比(Signal-to-Noise Ratio,SNR);b) 样本中不同菌株的拉曼光谱。
拉曼“去重”
360个菌落包含18类肠道微生物的混合模拟样本,按去重后36/360的菌落挑取数,可成功捕获原始平皿近95%的物种(Fig. 3a-b和Fig. 5a-c)。
Fig. 4拉曼智能化算法分析、聚类、挑取结果。
a)18类肠道菌株拉曼光谱特征相似性聚类结果;b) 根据a)聚类分布,捕获混合样本18类菌的算法挑选分布;c) 物种覆盖率与挑取菌落数量的关系。
03
研究结论
RAcolony高通量菌落智能筛选系统,在肠道细菌筛选中,挑取全皿1/10的菌落数量,获得85%-95%物种覆盖率的"菌中淘金术"。
04
应用优势
RAcolony高通量菌落智能筛选系统:
融合黑科技
高精度成像(识形态)、拉曼光谱(读指纹)和机械臂挑取(精准收割);
独创策略
"先AI去重,再批量扩培"的筛选策略;
压缩周期
免标记原位实时检测,周期从"周"缩至"小时";
降本增效
肠道细菌筛选中,仅挑取10%菌落,就能保留95%关键物种,大大降低鉴定成本。
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立即行动,
开启自动化筛选新时代!
告别传统低效!RAcolony开启工业酵母自动化筛选新时代
2025-05-30
2025-04-25
2025-02-21
2025-01-24
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