ARTP诱变育种设备的原理是，利用高纯氦气在高频电场中放电产生等离子体，其富含的高能化学活性粒子可以对菌株/植物细胞产生多重作用，如造成遗传物质的损伤、引起细胞膜通透性和蛋白结构的改变等；活性粒子对DNA物质的作用，可以引起DNA结构的多样性损伤；细胞启动SOS修复机制，SOS修复为一种高容错率修复，在修复过程中会产生种类丰富的错配位点，并最终稳定遗传进而形成突变株；配合后期筛选便可得到性状优良的突变株。