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Beckman Coulter声波移液系统与NEB Luna试剂强强联合,支持高通量qPCR和RT-qPCR检测

发布:贝克曼库尔特商贸(中国)有限公司
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荧光定量PCR(qPCR)是对核酸序列检测和定量的精 准方法,该方法需要荧光定量仪器,以及作为扩增荧光示踪的双链嵌合染料(例如:SYBR® Green I)和荧光修饰探针(例如:TaqMan 探针”)。


qPCR和RT-qPCR现已广泛用于基因表达研究、SNP分型、杂质筛查、传染病和癌症的分子诊断等。在这些应用中,高通量的qPCR实验能够带来巨大的优势,例如:在基因表达研究中可以同时监测更多的靶标、对照、重复组;在筛查试验中可做到更大规模,在分子诊断中可支持更多病人样本。在96孔板基础上,支持 384孔板的qPCR仪器有效提高了检测通量,然而手动加样建立反应体系,会带来很多不确定因素(例如:加样体积误差、漏加、错加等),并会耗费较长时间的人力。自动化移液系统可有效改善这些问题,提高效率,突破手动操作在整个流程中的瓶颈。


我们在研究中证实,NEB Luna系列qPCR试剂在高通量应用中表现卓 越,并与自动上样设备“贝克曼库尔特公司的Echo525声波移液系统”兼容。该仪器是以非接触移液方式进行小体积移液的设备,专为生命科学和基因组学而设计。使用声波完成移液是通过声波液滴喷射技术(ADE)实现,它将声波聚焦形成固定体积的小液滴(Echo525的液滴为25nL)从母板孔中转移到目标位置。这一技术实现了移液体积从纳升到微升的范围内,精确、快速的转移液体,同时避免传统枪头移液方式带来的交叉污染,并减少耗材和试剂的使用。


NEB Luna 系列 qPCR & RT-qPCR 试剂


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Beckman Coulter Echo 525声波移液系统


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Echo 525非常适合高通量qPCR体系建立,可以在10分钟内完成384孔板qPCR体系建立,并确保后续的qPCR实验检测灵敏、定量准确,并可减少反应体积。此外,使用 Luna Cell Ready One-Step RT-qPCR试剂盒,我们为细胞样本的自动化直接 RT-qPCR 分析提供了一个方便的工作流程,在Echo校准母板中进行细胞培养和裂解,提供可用于转移的模板裂解物ADE 介导的反应组装和高通量RT-qPCR分析。


NEB Luna 试剂与贝克曼库尔特声波移液系统和微量反应体系兼容


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使用 Beckman®Echo 525声波移液系统,在384孔板中建立10μl、5μl和2μl的Luna通用一步法RT-qPCR 反应体系,对7-log浓度梯度的人源GAPDH进行定量(25ng/μl–25fg/μl Jurkat总RNA),每个浓度重复8次。结果显示:在微量反应体系中,依然展现出良好的线性定量能力和低起始量检测。


Luna Cell Ready一步法RT-qPCR实验流程


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Luna Cell Ready一步法RT-qPCR试剂盒提供了直接从细胞(50µl体系可裂解高达10万个细胞)到RNA检测和定量的所有组分。Luna Cell Ready裂解模块整合了DNase I和Luna Cell Ready蛋白酶的功能,仅需15分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组DNA去除。2µl裂解产物(相当于0.2–4000个细胞中的RNA)即可实现20µl体系的RT-qPCR反应。


从Echo校准细胞培养母板到免提取一步法RT-qPCR检测的完整解决方案


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A. 将A549(人肺癌)细胞以每孔1000个细胞接种到384孔Echo校准母板中,培养过夜,并使用 Luna Cell Ready裂解模块(NEB #E3032)室温条件下裂解10 分钟。

B. 然后将裂解产物直接转移到Echo建立的Luna通用一步法RT-qPCR反应体系中。

C. 检测24个靶基因的相对表达,每个靶标有6个样品重复(细胞培养源板孔)和2个技术重复,总共 288 个反应。点表示重复(每个靶基因 12 个);线和数据标签表示靶基因与肌动蛋白(底部)相比的ΔCq。

D. 在类似的实验中,使用 Luna Cell Ready探针一步法RT-qPCR试剂盒(NEB #E3031) 使用探针法荧光定量检测了另外19个靶基因的相对表达。






2022-07-04
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