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中国农业科学院农产品加工研究所成立于2003年12月，是中国农产品加工领域的公益类国家级科研机构。农产品加工研究所建有加工工程、贮藏、保鲜与物流、质量安全、营养与健康等四大学科，粮油加工、肉品加工、果蔬加工、加工有害生物防控、加工化学危害物控制、传统食品与装备、营养与健康、生物制造与食品工程八大研究方向。