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超级引擎可搜索分子潜在治疗用途

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【导读】近日,上海交通大学Bio-X研究院生物信息中心和美国食品及药物管理局(FDA)的研究人员通力合作,构建了搜索小分子药物潜在治疗用途的搜索引擎,在老药新用研究方面取得重大进展,相关研...

近日,上海交通大学Bio-X研究院生物信息中心和美国食品及药物管理局(FDA)的研究人员通力合作,构建了搜索小分子药物潜在治疗用途的搜索引擎,在老药新用研究方面取得重大进展,相关研究成果已发表在近期的《核酸研究》(NucleicAcidsResearch)上。

在这项研究中,研究人员利用药物-蛋白互作组(Chemical-ProteinInteractome,CPI)在超级计算机上预测老药新用途。该超级机上收录重大意义的蛋白和小分子互作信息的背景分布,研究通过分子热力学模拟构建了小分子蛋白互作的指纹图谱,并对麻省理工学院预测小分子关联的算法进行改进,借鉴Google的搜索引擎算法,比较不同的药物和蛋白之间的互作指纹来搜索药物分子潜在治疗效果。

该项研究由贺林院士领导,主要参与人员还包括美国食品药品监督管理局IBMBlueMeadow(R)超级计算中心的麦克米凯洛夫博士,葛兰素史克(费城)研发中心项目组长LunYang博士,以及上海交通大学Bio-X研究院生物信息研究中心的罗衡和陈剑等。


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2018-11-08 09:23:03
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