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- 小东77523 2016-12-02 03:52:50
- PCR是DNA的体外扩增技术. DNA复制是有生命力的细胞在体内 自我复制的过程 ,属于体内扩增. PCR(聚合酶链式反应)原理 PCR是体外酶促合成特异DNA片段的方法,主要由高温变性、低温退火和适温延伸三个步骤反复的热循环构成: 即在高温(95℃)下,待扩增的靶DNA双链受热变性成为两条单链DNA模板;而后在低温(37~55℃)情况下,两条人工合成的寡核苷酸引物与互补的单链DNA模板结合,形成部分双链;在Taq酶的Z适温度(72℃)下,以引物3’端为合成的起点,以单核苷酸为原料,沿模板以5’→3’方向延伸,合成DNA新链。这样,每一双链的DNA模板,经过一次解链、退火、延伸三个步骤的热循环后就成了两条双链DNA分子。如此反复进行,每一次循环所产生的DNA均能成为下一次循环的模板,每一次循环都使两条人工合成的引物间的DNA特异区拷贝数扩增一倍,PCR产物得以2n的批数形式迅速扩增,经过25~30个循环后,理论上可使基因扩增109倍以上,实际上一般可达106~107倍。 DNA复制过程: (一)复制的起始 1.螺旋的松弛与解链 ⑴拓扑异构酶---能改变DNA空间构像的酶 作用:DNA复制时松弛超螺旋,以利复制叉的行进及DNA合成,合成后再引向超螺旋。 功能:不清楚,可催化体外拓扑异构化反应,拓扑异构酶分两型。 拓扑异构酶I (topoisomerase-- I ) 作用:松弛超螺旋,不需ATP, 作用机制:切开环状一条链、打结与解结 原核:拓扑异构酶I对负超螺旋作用>正超螺旋 真核:拓扑异构酶I对正、负超螺旋均有作用。 拓扑异构酶Ⅱ---旋转酶(gyrase) 作用:松弛超螺旋,作用机制: 切开环状两条链、打结与解结、环连与解环连 ⑵解链酶 (helicase)---复制蛋白rep 作用:ATP供能时,解开DNA双链。 原核:编码解链酶的基因是dnaB。前导链结合rep蛋白,随从链结合解链酶II、Ⅲ ⑶单链结合蛋白(SSB) 作用:SSB与解开DNA单链结合,保护稳定DNA。与新复制DNA单链结合,以防其降解。 螺旋松弛与解链过程如图所示 2.引发 ⑴引物酶(primase) 作用:以DNA为模板,自5'→3'合成RNA小片段约十几到几十个核苷酸, 3'末端为-OH。 原核:dnaG基因编码DnaG蛋白即引物酶。 ⑵引发前体(preprimosome) 由多种蛋白因子组成复合物。 作用:合成RNA引物,沿随从链复制叉的行进方向移动,在不同部位,合成RNA引物。 小结:合成RNA引物,在引物3'-OH末段进行DNA片段合成。 二 DNA链的延长 反应体系:DNA模板,DNA聚合酶,dNTP,引物,Mg2+ 反应式:DNA+dNTP→(DNA)n+1+ppi 真核与原核中DNA聚合酶(DNA polymorase-DNApol): 有几种类型,作用方式相同,但各具特性及功能。 1.大肠杆菌DNA聚合酶(3种) ⑴pol I:催化5'→3'的聚合作用,合成20个核苷酸即离开模板,填充空隙。 3'→5'外切酶活性,去除错误碱基,有校对作用。 5'→3'外切酶活性,去除RNA引物及修正错误碱基。 ⑵pol II:催化5'→3' DNA合成并具有3'→5'外切酶活性,体内功能不清楚。 ⑶pol Ⅲ: DNA链延长起主要作用,细菌中以1000dNTP/秒进行聚合反应。 3'→5'外切酶活性,校对作用,与pol I配合使错误率降至10-6。如图所示 DNA复制的保真性:遵守严格的碱基配对规律。-聚合酶对碱基的选择功能。聚合酶对错误碱基的校读作用。以上三种作用确保了DNA复制的准确性。 2、真核生物DNA聚合酶 特性与大肠杆菌相似,共五种:α、β、γ、δ、ε ⑴polδ:催化前导链及随从链的合成,需增殖细胞核抗原蛋白PCNA的参与。 ⑵polα:与引发酶配合,参与随从链的合成。 ⑶RFA(replication factor A):DNA延长中RFA与单链结合起到SSB的作用。 三终止 连接酶(ligase):使相邻的DNA片段,以3',5'磷酸二酯键相连,需ATP供能。
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