DNA提取异丙醇需要灭菌吗

矮胖丑挫穷 2017-04-02 07:48:06 376 浏览

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幻雪夜57 2017-04-03 00:00:00

细菌DNA提取方案：革兰氏阴性菌，如E.coli，一般有三种可以选择的方法。一、水煮模板法——主要用于PCR反应 1、接种单菌落于LB或脑心平板，连续画线，37摄氏度培养18－24小时。 2、刮取1～2接种环菌苔加入150微升三蒸水中，混匀，100摄氏度煮沸10分钟。 3、12000转/分钟离心10分钟，取上清，－20摄氏度保存备用。操作Z简便，对试剂条件要求低。缺点是纯度不够高，可能会含有RNA、蛋白等杂质。但是作为一般检测目的的PCR反应模板已经足够了。有人称扩增4kb以下片段都可用此种方法制取模版，编者用此类模板PCR可以扩增到3500bp的片段。建议：此法得到的模版保存时间短，强烈建议每月重新制作一次。二、CTAB/NaCl 法 1、接种一单菌落于5mlLB中，30℃培养过夜， 2、取1ml种子培养液接入100ml2%LB中，37℃、220r/min培养16小时; 3、5000r/min离心10分钟，弃去上清。 4、加入10mlTE离心洗涤后，用10mlTE溶解菌体，混匀，-20℃保存备用。 5、取3.5ml菌悬液，加入184μl10%SDS，混匀，加入37μl10mg/ml蛋白酶K，混匀，37℃温育1小时 6、加入740μl5mol/LNaCl，再加入512μlCTAB/NaCl，混匀，65℃温育10分钟。 7、加入等体积的氯仿/异戊醇，混匀，10000r/min离心5分钟，保留上清。 8、上清中加入等体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1)，混匀，10000r/min离心5分钟，保留上清。 9、加入0.6倍的异丙醇，混匀，10000r/min离心5分钟，收集DNA沉淀，用70%乙醇离心洗涤DNA沉淀。 10、用1mlTE溶解DNA，加入终浓度为20μg/mlRNaseA，4℃保存。 CTAB/NaCl法提取的DNA纯度较高，蛋白杂质较少，保存时间长，编者更喜欢把终浓度为20μg/ml RnaseA加在第5步温育的时候，这样Z后没有RnaseA污染。每一步操作细致一些，得到的DNA可用于Southern blot。建议：长时间保存DNA可放于-20℃，但要尽量减少反复冻融，否则影响DNA质量。三、盐析法 ‍ 1、1.5ml对数期菌液 2、12000rpm 30 s 3、200ul裂解液（同CTAB/NaCl法），37c，1hr 4、66ul 5M NaCL，混匀充分，12000rpm 10min 5、上清用粗枪头取至新管 6、等体积酚充分混匀，12000rpm 3min，反复抽提至无蛋白层 7、取水层，等体积氯仿混匀，12000rpm 3min 8、上清至新管，2倍体积预冷无水乙醇 9、-20C，20min，14000rpm， 15min 10、400ul 70%冷乙醇洗涤 11、干燥，100ul 20ug/ml RNaseA，37C，30min 12、2倍体积无水乙醇沉淀，70%冷乙醇洗涤 13、干燥，溶于100ul TE 介于方法一和方法二之间，CTAB虽然取出糖分效果较好，但CTAB本身也是有毒的，所以此方法放弃了CTAB。革兰氏阳性菌，由于细胞壁的结构与阴性菌有差别，裂解比阴性菌稍微麻烦一些，可以采取CTAB/NaCl法稍加修改，在第四步加入终浓度2mg/ml的溶菌酶，37度温育1h。实验注意：提基因组Z好要将枪头尖剪掉（剪掉以后在酒精灯上迅速过一下，使其断口圆滑）。以免枪头损伤基因组！抽干时Z好是风干！

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高压灭菌器灭菌时间需要多长？: 简而言之：灭菌温度越低,需要的灭菌时间越长；灭菌温度越高,需要的灭菌时间越短
压力蒸汽灭菌的时间，要从灭菌器柜室内达到灭菌要求温度时算起，直至灭菌完成为止。

总时间包括：
1、 热力穿透时间
即从消毒柜内达到灭菌温度至消毒物品ZX部位亦达到灭菌温度所需时间。时间的长短取决于消毒物品的性质、包装的大小,放置位置和高压锅内空气排空程度和灭菌器的种类。
2、 消毒维持时间
即杀灭微生物所需的时间，一般用杀灭脂肪嗜热杆菌芽胞所需时间来表示。在115℃时需30分钟，121℃时需12分钟，132℃时需2分钟。
3、 安全时间
一般为维持时间的一半，其长短视消毒物品而定。对易导热的金属器材的灭菌，不需要安全时间。
下表提供的数据可供实际工作中参考。
注：
*包装体积 < 30×30×30cm3
**对于粘性液体，如琼脂培养基等，应延长时间5～10分钟。
1)    一般下排气式所需时间为：115℃需要30分钟、121℃需要15分钟、126℃需要10分钟
2)    115℃常用于制药工业上的灭菌。在微生物实验室内，有些含糖培养基亦用115℃30分钟灭菌，因为在更高温度下糖会分解。
3)    121℃～126℃常用于YL卫生和防疫工作中的灭菌。
以上所述知识灭菌时间的概数，1次灭菌中具体使用多少时间，需要根据物品的种类、包装的大小、安放情况和灭菌器的性能来确定。