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小牛肠碱性磷酸酶&虾碱性磷酸酶,傻傻分不清楚?

来源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新时间:2023-04-18 00:00:00 阅读量:79
导读:分子克隆包含:目的基因扩增、载体线性化、连接以及转化筛选。说到载体线性化,除了PCR线性化载体,大多数小伙伴会选择酶切进行载体线性化。对于一些单酶切位点的线性化载体,我们常常需要碱性磷酸酶进行载体去磷酸化。

分子克隆,一个大家做实验必经的实验流程。我们可以通过分子克隆将所需的目的基因连接到载体上,最后导入表达系统中进行表达。分子克隆包含:目的基因扩增、载体线性化、连接以及转化筛选。说到载体线性化,除了PCR线性化载体,大多数小伙伴会选择酶切进行载体线性化。对于一些单酶切位点的线性化载体,我们常常需要碱性磷酸酶进行载体去磷酸化。

 

01
碱性磷酸酶是什么?

碱性磷酸酶,可以将DNA、RNA的5’端磷酸基团去除,常用于阻止载体的自连作用,也可用于酶法化学发光。在分子克隆实验中,DNA连接酶催化DNA连接时需要有磷酸基团的存在,载体在经酶切后会在切点端保留一个磷酸基团。而载体经碱性磷酸酶去磷酸化后因5’端无磷酸基团,因而不可以和自身3’-端连接。因此连接反应中载体本身会优先发生的连接反应被阻止,提高了目的片段插入率。在我们使用完碱性磷酸酶之后,载体的5’端磷酸基团被去掉,载体自身在普通的连接酶作用下不能进行连接;但载体和片段之间形成3´,5´-磷酸二酯键,连接双链其中的一条,另一条链则靠大肠杆菌自身的修复系统进行连接。

 
 

 

02
小牛肠碱性磷酸酶和虾碱性磷酸酶的差异是什么?

小牛肠碱性磷酸酶(CIAP)和虾碱性磷酸酶(SAP)都可以去除载体或片段的5’-末端磷酸基团,但失活方法不同。

小牛肠碱性磷酸酶,在底物浓度高时,CIAP的最适pH约为10;底物浓度低时,最适pH约为8,但特异性比高底物浓度时低。同时,其在保存条件下极其稳定,但在螯合剂存在条件下,经65℃、30分钟加热处理99%的活性不可逆失活。失活处理时,建议试用苯酚,从而使酶完全失活。

虾碱性磷酸酶,可以在65℃ 加热 5 分钟的条件下不可逆失活。同时,在进行去磷酸化反应之后,不需要纯化产物,可直接用于后续的连接反应。虾碱性磷酸酶也可以用来降解PCR反应中的游离dNTP,用于制备测序模板和 SNP 分析。同样无需纯化,可直接用于下游实验。

 

03
使用碱性磷酸酶去磷酸化反应之后,该如何检测?

载体线性化后,去磷酸化检测:在我们对线性化的载体使用了碱性磷酸酶进行去磷酸化之后,可以直接将酶切后的载体加上T4 DNA连接酶进行酶连,然后进行转化涂平板并计算菌落数。将酶切后的载体直接进行转化涂平板并计算菌落数。比较没有经过酶连以及经过酶连的两个平板的菌落差异。若两次实验的差异不大那么就证明去磷酸化效率高。

除了两种碱性磷酸酶,翌圣生物还有更多的克隆及克隆筛选相关试剂供您选择。

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应用场景

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10922ES

/多片段快速克隆、定向克隆

Hieff Clone® Zero TOPO-TA Cloning Kit
零背景TOPO-TA克隆试剂盒

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