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BD 单细胞测序系统

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货号:633701

 

产品简述

——为推动单细胞研究的进展,测序巨头相继推出新一代测序仪,其中BD RhapsodyTM单细胞分析系统便是其中的佼佼者,此系统的诞生基于BD在细胞生物学领域40年的专业技术,克服了传统检测的局限性,能够对成全上万个单细胞的数百个表达基因同时进行数字定量,每个细胞提取独立数据,体现异质性,可以鉴定和表征新型和罕见细胞类型,有助于理解从免疫学到肿瘤学等多个领域内的生物学过程。

 

BD RhapsodyTM单细胞分析工作流程

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BD Rhapsody核心技术

——BD Rhapsody利用微孔进行单细胞分离,属于Micriwell-seq。20万个微孔的尺寸被设计成一个微孔恰好可以容纳一个bead(磁珠),bead上连接逆转录引物,引物主要包括以下几个部分:

  • CL(cell label,细胞标签),一个磁珠上的引物CL序列相同,不同磁珠上的引物CL序列不同,从而达到区分序列的作用

  • UMI(unique molecular identifier),一个磁珠上的引物UMI各不同,可以区分最初的mRNA分子,以便后期分析时消除扩增带来的偏差

  • poly dT,和mRNA 3'端poly A互补配对。同时悬液被稀释到适当浓度,微孔随机捕获单细胞,单细胞捕获率为80%,捕获1K个细胞出现的多细胞比率约为0.2%,捕获10K个细胞多细胞比率约为2.4%。Rhapsody建议检测通量为100-10000。

 

一个微孔=一个单细胞=一个磁珠=一个RNA-Seq

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BD Rhapsody技术优势

  • 靶向基因检测,避免看家基因占用大量测序数据,节省测序和分析成本

  • 靶向定制panel,选定特定基因组合,提高UMI计数效率,罕见转录本检测阈值更低

  • 引入单细胞测序金标准,BD分子标签,降低非特异性表达

  • 完整cDNA可在磁珠微球结构保存长达16周,随用随取

  • 单次实验AbSeq kit通过独特的抗体标记方法,既可以提高样品通量(最多12个样本同时建库,可等分,可随机组合),又可同时进行单细胞蛋白和转录组联合检测,降低成本的同时,也为单细胞多组学研究提供了更高 效的平台

  • 可分辨更精细、微观的细胞群和细胞亚种群

  • 捕获效率高达97%,远高于市场上目前所有大通量单细胞转录组测序技术

 

 

 


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