MinION MK1C纳米孔测序仪

MinION MK1C是一款全方位集成的、完全便携式测序和分析测序仪，利用先进的纳米孔测序技术，实现对DNA和RNA分子的高通量单分子实时测序。
1.原理：单分子纳米孔测序技术。
2.品牌：Oxford Nanopore Technologies（ONT），UK英国
3.应用类型：全基因组测序、靶向测序、RNA测序、宏基因组测序、表观遗传学等。
4.样本类型：基因组DNA、扩增子/PCR产物、cDNA、RNA。
5.环境：
5.1 储存环境：温度要求：10~30℃、湿度要求：5%~95%
5.2 工作环境：野外/现场、实验室、移动实验车
1) 温度要求：18~25℃
2) 湿度要求：10%~80%
3) 电源要求：100~240 VAC (50/60Hz)
4) 其他要求：网络
6.仪器参数：
1)流动槽（flow cell）：1个MinION/Flongle测序芯片槽
2)体积：3*14*11.4 cm（高30mm | 宽140mm | 深114mm）
3)重量：420g 
4)预装软件：Linux操作系统、MinKNOW、Guppy、EPI2ME
5)CPU：ARM 6核处理器
6)GPU：256核GPU
7)内存：8 GB RAM
8)储存：内置1 TB固态硬盘，支持USB及SD移动存储
9)触摸屏：OLED触摸屏
10)网络支持：Wi-Fi，GSM、UMTS及LTE模式的蜂窝网
7.仪器性能：
1)测序通道数量：512（2048）/MinION测序芯片槽或216/Flongle测序芯片槽；
2)起始样品量：10pg~5ug；
3)测序样品上样量：≥100ng，75ul；
4)运行时间：1min~48hrs（按需可控）；
5)测序速度：450bp/s（DNA）、70bp/s（RNA）；
6)运行数：1个flow cell实验；
7)芯片使用寿命：72 hrs；
8)原始数据存储。
8.性能指标
1)文库制备时间：10min（Rapid）或2hrs（Ligation）；
2)DNA/RNA直接测序（RNA无需转换成cDNA即可进行测序）；
3)获取序列时间：运行2min；
4)序列条数：4.4 Million(百万)reads（以10kb长度计算）；
5)读长长度：从200bp至2Mb；
6)测序数据产量：10~30 Gb/MinION flow cel；200Mb~2Gb/Flongle flow cel；
7)碱基质量：99%；
8)碱基修饰：直接检测碱基修饰信息（甲基化检测）；
9)分析Nanopore测序数据的工具：≥30种、开源；
10)集成设备：仪器本身为高性能计算机，可实时完成数据获取，存储以及碱基转换（basecalling）。

优点：
1.MinION Mk1C结合了MinION实时快速可手持测序、Flongle强大的集成计算和高分辨率触摸屏的优点， 能够为DNA/RNA测序提供全方位的解决方案。
2.安装简便：全方位集成的、完全便携式测序和分析测序仪，没有复杂的激光或光路系统，直接连接电源即可使用，无需日常维护。
3.单分子测序：DNA/RNA可直接测序，无需PCR扩增，免除PCR扩增带来的错误和GC偏差，快速、实时。
4.直接RNA测序：提取RNA无需转换成cDNA即可进行测序。
5.甲基化检测：碱基修饰基于电信号的差异检测碱基，在DNA/RNA测序同时可直接检测碱基修饰。
6.数据产生快速：提供先进的单分子实时测序，上机后2分钟产生碱基序列数据。并可以根据实验需求设置测序反应时间。
7.实时分析：可在测序同时完成原始电信号碱基读取（Fast5 To FastQ）、数据质量控制（QC）、barcode拆分（Demultiplexing）、序列比对（Alignment）、基因组组装（Assembly）、宏基因组分析（Metagenomics）、扩增子分析（Amplicon）、测序错误校正（Error correction）、变异分析（Variant calling）、碱基修饰（Base modification）等。