Thermo Scientific™Amira™及Avizo™软件是功能强大的三维可视化与分析软件,为生命科学及材料科学领域提供广泛的三维数据探索与解决办法。软件支持处理不同图像采集仪器获得的大量的多模态数据,包括光学和电子显微镜,CT,MRI等技术。
Amira-Avizo 软件处理数据快速且灵活,支持先进的2D-5D生物成像工作流程,也为材料表征提供优化的工作流程。同时软件具有强大的图像处理工具、数字模拟以及先进的缺陷分析等功能。
主讲人简介
diyi讲 4月16日 上午10:00-11:00
小鼠全脑血管网络的三维可视化与定量分析
殷宪振,ZG科学院上海药物所高级工程师,计算机软件与理论硕士,药剂学博士。
主要从事药物制剂结构及生物医学图像数据挖掘的交叉学科研究工作。在国际上率先开展基于同步辐射的制剂结构研究,建立了系统的结构药剂学研究方法;设计部署Tera Byte规模神经影像数据挖掘系统,实现神经回路、血管形态学、细胞形态学的深入量化分析。迄今发表SCI论文40余篇,获ZL授权9项。
第二讲 4月22日上午10:00-11:00
土壤内部三维孔隙结构分析研究
於修龄 , 浙江大学环资学院助理研究员,毕业于浙江大学环资学院,博士。
研究方向为土壤环境物理学。以高分辨率CT结合图像处理技术为主要研究手段对土壤内部的三维孔隙结构进行研究。目前在《European Journal of Soil Science》,《Soil Science Society of America Journal》,《Soil & Tillage Research》等国际权威学术期刊上发表论文十余篇。
第三讲4月29日上午10:00-11:00
生物电镜三维重构技术及其数据处理解决方案
刘轶群,北京大学生命科学学院仪器ZX电镜平台工程师,毕业于北京大学生命科学学院,博士。
主要负责聚焦离子束/电子束双束扫描电镜(FIB-SEM)及高压冷冻等设备,在常规透射和扫描样品制备、基于扫描电镜三维重构的样品制备、高压冷冻以及电镜三维重构数据处理等方面积累了丰富的经验。
随着技术的发展,特别是高分辨背散射电子探头和低电压下高性能电子枪的出现,极大的增加了基于扫描电镜三维重构技术的分辨率。扫描电镜让自动获取上千张连续的‘超薄切片’图像成为可能,降低了电镜三维重构技术的门槛,使得电镜三维重构应用变得非常普遍。电镜三维重构的普及让数据处理变成了不能忽视的问题,Amira软件是非常适合电镜三维数据处理的软件,本次报告结合平台已经获得的结果,主要分享生物电镜三维重构技术和Amira数据处理的经验,对相关领域的科研及技术人员提供有效的解决方案。
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