目前国内外的冻干机均可带箱内压塞装置，压塞装置的压板由设在干燥室液压装置主要由电动机、油泵、单向阀、溢流阀、节流阀、电磁阀、油箱、油缸及管道组成。液压活塞杆控制隔板升降，应能进行蒸汽或其他方式灭菌。活塞杆经常进出油缸，虽有两道密封圈，仍不能完全杜绝活塞杆表面的油膜污染干燥室内腔完全隔离，彻底消除液压油的污染问题。
冻干机压塞装置的主要功能：
1.用于小瓶冻干后在箱内整箱压塞，小瓶上的塞子是带有缺口的特殊塞子，在分装之后立即放在每个瓶口上，由于塞子带有缺口，并不影响升华干燥，而在冻干结束时可以在真空状态下压塞，亦可以充氮压塞，既减少了生产工艺环节，又减少了产品的污染机会。
2.有利于产品的进箱和出箱，特别对于大型的冻干机，进箱时把板层降下，先进上层，然后，边进边升；出箱时先出下层，然后边降边出，避免了使用凳子或梯子进出箱，当然活塞杆应该是设计在箱顶上的才有这种功能，有些制造厂把活塞设计在箱底部的就无此功能。
3.利于冻干箱内的清洗工作，由于板层能升降，冻干箱内各处就容易接近，利于清洗。根据GMP的要求，活塞杆应是采用不锈钢制造的，有些带有蒸汽灭菌的冻干机在活塞杆上还带有不锈钢波纹管的护套，以确保冻干箱内严格灭菌。
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