在NGS检测实验中,DNA文库构建的第一步就是将DNA随机打断成符合各测序平台读长的片段。相信熟悉NGS文库构建的科研人员一定纠结过这个问题,是用酶解打断还是超声波打断?
目前DNA打断的最主要的方法超声法和酶解法。但是这两种方法在实际使用中各具优势,需要根据实验者自身的情况进行选择。
超声波打断法:
操作简单,耗时短,成本低;随机片段化,无GC序列偏好;剪切效果不受DNA浓度影响
片段化结果集中度高,目的长度片段得率高。
酶切法:
实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高;存在序列偏好性;需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响;目标长度片段集中度较低。
超声打断法的优势显而易见,而常用的超声波打断仪分为接触式和非接触式。相比传统的探头超声波破碎仪,探头与样品直接接触,一次只能处理一个样品,实验周期长。小美非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品可在密闭容器下进行破碎,不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,此款仪器具有处理高通量,样本低损耗,无交叉污染等优势。逐渐成为ChIP(染色质免疫共沉淀)和DNA剪切研究平台不可缺少的标准化工具。
小美超声非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品具有通量高、实验一致性好,实验重复性好、片段得率高等优点。专为二代测序DNA样本与染色质免疫共沉淀实验样本前处理量身订做的,应用领域包含:细菌细胞破碎、蛋白质抽提;二代测序样本DNA片段化;霉菌孢子破碎、乳化、均质、加速溶解、催化反应等。
采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合;用于无菌、可超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。深受各大基因公司、生物公司、测序公司的青睐!
“芯”河滚烫2021年“SEMICON China”如期而至,行业大咖齐聚在这一片“芯”辰大海。 作
作为一种分析技术,进口成分分析仪可以为人们提供有关晶体材料的结构和相ID的信息,目前已广泛应用在地质勘探、矿
认识病毒做好科学防护日立电镜大显身手PART.01认识病毒 诺如病毒可能引起急性肠胃炎的 一种病毒&
新型Flukeii910超声波局放成像仪,可以快速定位电气设备的局部放电缺陷是电气测试工程师和电网维护团队的
脊髓性肌萎缩症(SMA)脊髓性肌萎缩症(SMA),是一类由脊髓前角运动神经元变性导致肌无力、肌萎缩的疾病。由
1937年,德国化学家奥托·拜耳博士发明了我们称之为聚氨酯的多功能塑料。聚氨酯是通过多元醇与异氰酸酯反应生成
我想做一个基于VB6.0和51单片机的超声波液位计,单片机通过超声波测距模块测距,并通过URAT串口和上位
雷达是用电磁波呢,还是用超声波呢?超声波与电磁波又有什么不同呢?我记得雷达是仿造蝙蝠造的,而蝙蝠用的是超声
用超声波模块进行测距,有几个疑问: 1、模块自动发送8个40khz的方波,这8个方波遇到多个物体时有没有
我们想装一批超声波雾化喷头,但不知道这东西多少钱一个,请大神给个参考!... 我们想装一批超声波雾化喷