- 2025-01-10 10:52:40高通量化合物库合成
- 高通量化合物库合成是一种高效的化学合成技术,它能够在短时间内合成大量结构多样的化合物。该技术采用自动化和并行化的合成策略,显著提高了化合物合成的速度和效率。高通量化合物库在药物研发、材料科学等领域具有广泛应用,能够帮助科研人员快速筛选出具有潜在活性的化合物,加速新药和新材料的研发进程。其高效、快速的合成能力,为科学研究和技术创新提供了有力支持。
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高通量化合物库合成问答
- 2025-05-20 20:40:56GelMA合成步骤
- 打扰大家了,想咨询一下GelMA合成过程使用A型明胶还是B型明胶呀?
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- 2023-06-25 12:12:24生物样本库建库难?上云学院“粽”享知识&好礼
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- 2025-01-17 12:00:15dna合成仪生产商未来发展如何?
- DNA合成仪生产商:创新与科技引领基因合成的未来 在生物技术的飞速发展中,DNA合成仪作为关键设备之一,已成为现代科研和生物医药行业的重要工具。随着基因编辑、基因以及个性化医疗的崛起,DNA合成仪的市场需求日益增加。本文将深入探讨DNA合成仪生产商的市场现状、技术创新及其对科学研究和产业应用的深远影响,帮助读者了解DNA合成仪产业的未来趋势及其潜力。 1. DNA合成仪的市场前景 DNA合成仪,顾名思义,是一种能够根据预设的序列合成特定DNA分子的设备。这类仪器广泛应用于基因工程、制药行业、癌症研究以及疫苗开发等多个领域。随着基因合成技术的不断进步,DNA合成仪的性能也在不断提升,包括提高合成速度、准确性和成本效益,使得科学家能够更快速、更高效地进行基因合成及实验研究。 目前,DNA合成仪的需求不仅仅局限于学术研究机构,越来越多的生物技术公司、制药企业和诊断公司也开始引入这一技术。这种趋势促使DNA合成仪生产商不断推陈出新,满足日益复杂的市场需求。 2. DNA合成仪生产商的技术创新 DNA合成仪生产商在设备的设计和技术创新方面已经取得了显著进展。传统的DNA合成方法存在一定的时间和成本限制,然而现代DNA合成仪利用自动化技术,大大提升了合成效率和精度。例如,采用光学检测技术、固相合成法等新兴技术,能够在合成过程中实时监控反应进程,确保高质量的DNA产物。 一些领先的DNA合成仪生产商也在努力降低设备的使用成本,提升小批量合成能力。这对于企业和科研机构来说是极具吸引力的优势,尤其是在面对基因编辑和个性化医疗领域的快速发展时,灵活的合成能力成为了行业发展的关键。 3. 领先的DNA合成仪生产商 目前,有多家知名的DNA合成仪生产商在该领域占据了领导地位。著名的公司如Thermo Fisher Scientific、Agilent Technologies和BioAutomation等,凭借其强大的研发能力和技术积累,已成为行业中的佼佼者。这些公司不仅在设备制造上不断突破,且通过提供定制化的DNA合成解决方案,满足不同用户的需求,推动了整个行业的技术进步。 随着中国在生命科学领域的崛起,一些本土DNA合成仪生产商也逐渐走向国际市场,凭借较为合理的价格和不断创新的技术,受到了科研和生物技术公司的青睐。 4. DNA合成仪的应用前景 随着个性化医疗和基因编辑技术的不断发展,DNA合成仪的应用前景非常广阔。在基因领域,能够精确合成所需DNA序列的技术使得基因修复、基因替代以及基因免疫等方案成为可能。与此DNA合成仪还在生物制药领域中扮演着重要角色,帮助开发新的药物和疫苗。 5. 结论 总体而言,DNA合成仪作为现代生物技术的核心设备之一,正在不断推动着生命科学领域的创新与突破。从科研到产业应用,DNA合成仪生产商正在不断通过技术革新满足不同市场需求。随着基因合成技术的进一步发展,未来DNA合成仪的市场前景将更加广阔,为生命科学研究和生物医药行业提供更加精确、高效和便捷的工具。 通过深入分析DNA合成仪的技术发展及应用前景,可以看出,这一领域将继续迎来新一轮的技术创新和市场扩展。
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- 2023-04-10 15:50:43合成生物学握手AI,你想要的合成生物学
- 根据NCBI的ClinVar数据库统计,包括罕见疾病,如镰状细胞病、地中海贫血和先天性莱伯黑朦等超过3万7千种已知疾病与致病性单核苷酸变异(SNV)有关,SNV可能导致原始DNA序列、转录水平和蛋白质序列等其他特性的变化。而新一代CRISPR/Cas9技术——碱基编辑器(BEs)可以有效地修复碱基突变,而不会诱导双链DNA断裂,从而能够直接、不可逆地校正碱基突变,对于治愈SNV引起的遗传疾病具有十分广阔的前景。已经报道的有诱导C·G到T·A转化的胞嘧啶碱基编辑器(CBE)、诱导A·T到G·C转化的腺嘌呤碱基编辑器(ABE)和使C·G到G·C转换的糖基化酶碱基编辑器(GBE),这些BEs为治 疗50%以上致病性SNV提供了几乎理想的解决方案。然而,在实施基于BE的基因疗法之前,有必要大量构建具有致病性SNV的细胞疾病模型,以用于开发和优化BEs,并使其在基因治 疗中的应用成为可能。同时,根据ClinVar的数据,大约50%的人类致病性SNV是C·G到T·A的转化,然而目前很难通过合理的人力和资金投入获得大量携带这些SNV的细胞模型。这一方面是由于大规模样品,手动操作不仅耗时,而且容易出错,一致性较差且成本高昂;另外一方面,现有的基于目标-位点集成库的方法,如Be-Hive等在为AI学习和预测编辑性能的数据时,缺乏原位信息的综合编辑位点数据,同时又缺少真实染色体环境(先前研究表明,核酸酶的性能与染色质可及性之间存在很强的相关性,并且基因编辑在真核染色质中比异染色质中更有效)。中科院天津工业生物技术研究所和天津科技大学的团队,开发了一个由以下四个模块组成的用于哺乳动物细胞高通量原位基因编辑的自动化平台,实现了哺乳动物细胞基因编辑的标准化和可拓展性。(1)内源性靶gRNA计算机辅助设计;(2)gRNA表达质粒构建;(3)哺乳动物细胞碱基编辑;(4)CBEs性能模型构建的机器学习。四个模块组成的用于哺乳动物细胞高通量原位基因编辑的自动化平台,实现了哺乳动物细胞基因编辑的标准化和可拓展性。该平台借助大规模的原位编辑数据和序列信息,结合局部染色质可及性,具有原位数据的机器学习模型能够更好地预测实际的碱基编辑效率,使获得内生目标的大规模编辑数据集成为可能。图1 全自动高通量哺乳动物基因编辑平台概览在这四个模块中,第 一个模块用于负责gRNA设计,以将人类致病性SNV引入野生型细胞,作者使用生物信息学分析选择了1210个基因作为靶位点,使用包含每个靶位点上游3 bp至下游750 bp靶区的DNA序列,分批处理用于分析编辑结果的三对引物。对于自动化gRNA质粒构建工作流程模块,gRNAs质粒构建过程中采用了贝克曼库尔特Echo纳升级声波移液系统用于操纵DNA组装反应,相对于标准的Golden Gate DNA组装方法的反应体积为15μl,Echo的纳升级和无吸头操作能够对实验步骤进行一系列优化,将反应系统最小化到1微升的总体积,从而显着降低了实验成本。随后使用贝克曼库尔特Biomek i7自动化移液工作站将DH5α感受态细胞与Golden Gate产物进行混合,通过ClonePix进行转化铺板,并在通过DNA测序验证构建质粒之后,使用Biomek i7进行质粒提取。为了分析数据编辑结果,使用Python脚本读取sanger测序文件,比较N20,并创建两个参考csv文件。错误的组装csv文件包括一个选择列表,用于从48孔细菌菌落板到96孔深孔板中挑选新菌落,以便ClonePix进行另一轮验证。正确组装csv文件包含N20测序及其在96孔深孔板中的位置,用于使用贝克曼库尔特Biomek i7自动化移液工作站进行质粒提取。此模块高通量自动化系统在4天之内共构建和分析了1210个gRNA质粒,成功率达99%,实现了每天384个gRNA组装的通量。而后续使用Biomek i7进行的质粒提取,通量则可达到576个质粒/天。图2 全自动gRNA质粒构建工作流程概述示意图第三个模块是哺乳动物细胞中的碱基编辑,如图3。通过优化实验条件,作者开发了使用Biomek i7自动化移液工作站进行包括细胞接种和转染、细胞培养基更换以及进行样品收集在内的编辑过程。随后进行靶区域的细胞裂解和PCR扩增。全自动高通量系统在6h内将1210组gRNA和BE4max质粒共转染到HEK293T细胞中,并在2 h内完成后续培养基更换。培养5天后,收获编辑的细胞于8小时内完成进行PCR分析,然后进行sanger测序。使用Python脚本产生3个csv文件,一个用于准备新一轮PCR的挑选列表,以分析使用Biomek i7从96孔裂解样品板到96孔PCR板的false sample;第二个csv文件包含用于分析false sample的第二个引物对的序列和位置信息,用于新一轮PCR;第三个csv文件包含正确的样本和编辑效率结果,用于下一步的AI学习。图3 自动化基因编辑过程的工作流程概述第四个模块为作者开发的AI模型——染色质可及性学习模型(CAELM),预测基础编辑的结果。CAELM基于自动化平台生成的高度均匀的原位基因组编辑数据,预测HEK4T细胞中的BE293max行为,并实现了0.64的皮尔逊相关值。皮尔逊r是评估数值数据模型准确性的最普遍指标之一,CAELM模型中考虑了目标序列的真实染色体环境,这提供了更好、更现实的预测;同时,CAELM还提供了模型输入的特征重要性得分,并揭示了DNA可及性相对于目标序列上下文的贡献在预测中接近1:6。通过与32个不同基因组位点的手动操作进行比较,其中16个目标位点在两个操作过程中的编辑效率几乎相等,而自动化高通量系统在其他14个位点的统计分析中表现出更高的编辑效率。这些结果表明,自动化高通量系统能够以与手动操作相当的效率执行基础编辑;随机选择BE4max编辑靶标的1210个与疾病相关的SNV的编辑效率均达到了较高水平,说明可以同时有效地操纵数千个内源性靶位点的人类细胞的全自动高通量原位基因编辑平台的成功建立。
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- 2023-02-15 19:15:40揭秘 | NGeniuS,如何一键运行NGS自动化建库
- 你的自动化NGS文库构建真的全自动简单易用吗?高通量测序技术广泛应用到产前诊断、肿瘤临床诊断、遗传学疾病检测、药物基因组学检测等各个领域。其中湿实验NGS建库因为流程复杂、步骤繁琐、耗时长等因素,自动化移液工作站代替人工已经被测序行业广泛采用。搭建成熟稳定的自动化建库平台需要经过编辑、测试、优化,方能投入使用,还可能面临处理样本数量不够灵活和以8为倍数制样的试剂浪费,有时还伴有手工半自动操作,需要培养熟练的设备管理人员等问题。贝克曼库尔特生命科学特推出的Biomek NGeniuS全自动文库制备系统,具备简单易用的防错设置、无人值守的自动化处理、以全新的方式开启“一键式自动化”NGS。今天小贝将为你揭秘Biomek NGeniuS是如何实践极简主义,用一个按钮进行自动化建库。图1. Biomek NGeniuS 全自动文库制备系统一键开启NGS自动化建库Step.1免编应用程序 轻松设置方法在Biomek NGeniuS Portal,支持您从NGeniuS电子应用程序库中直接选择需要使用的方法,无需方法编辑调试优化。您可以输入今日运行的批次名称、样本数量,灵活地调整建库投入量, PCR循环数,磁珠晾干时间等细节参数,并选择建库实验的安全起始点。Step. 2工作辅助材料 帮助试剂准备完成实验设置后,可下载打印工作辅助表,根据表单提示准备所需试剂。Step.3 拨动导航转盘 一键运行你的实验Biomek NGeniuS主机的实验运行仅需控制一个唯 一的导航转盘。实验批次的信息和选择菜单将显示在背部的24英寸平视显示界面中,视图清晰简洁,内容一目了然。图2. Biomek NGeniuS导航转盘与平视显示界面首先,平视显示器所示的信息将指引您完成建库实验的试剂、耗材摆放。Dynamic DeckOptix光学分析技术将自动实时识别耗材种类与摆放位置是否正确,避免耗材摆放错误的发生。OCR(光学字符识别技术识别)技术,则帮助识别试剂盒标签,判断试剂使用是否正确。随即Biomek NGeniuS通过液面探测技术,自动判断试剂管内试剂量是否足够并进行试剂分装。分装完成的试剂盒可收回冰箱存储。NGeniuS即可开始建库实验,平视显示器将同步显示建库完成时间。配合内置热循环仪,机械手搬运系统以及温控模块,NGeniuS 支持全流程无人值守。您可以通过Biomek NGeniuS Portal软件远程实时查看,随时随地掌握实验动态,合理安排实验室工作进度。不断丰富的应用程序库Biomek NGeniuS不需要进行建库试剂盒方法的编辑,直接从应用程序库里面下载开发完成的应用程序即可使用。同时,贝克曼库尔特生命科学旨在不断丰富应用程序,相继与IDT, Illumina, AmoyDx,Pillar Biosciences等基因测序和分析解决方案公司签订应用开发协议,在 Biomek NGeniuS全自动文库制备系统上开发应用程序,持续扩展电子应用程序库列表,满足科研端及临床转化不断迭代变化的试剂盒方法需求。
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