2025-02-28 18:58:17噬菌体展示文库构建
噬菌体展示文库构建是一种生物技术方法,通过将外源基因或肽段插入噬菌体基因组中,使外源序列在噬菌体表面表达,形成噬菌体展示库。该技术能高效筛选特定结合特性的抗体、酶或其他生物分子,广泛应用于药物研发、疫苗设计、蛋白质相互作用研究等领域。通过构建噬菌体展示文库,可快速鉴定具有特定功能的生物分子,加速生物医学研究进程。

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2023-06-16 14:28:25构建表达载体想降本增效?看这一篇就够了
想要开发有稳定生产能力的细胞株,除了在细胞开发中对于细胞表达能力的评估筛选以外,前期的表达载体的构建过程也非常重要。使用纳升移液技术可以显著提高细胞株过程基因合成,表达载体构建以及转染筛选等实验的实验效率,降低实验成本。声波移液展示Echo®移液系统依靠专 利技术(U.S. Patent 6938995)和创新方法改变移液操作在整个生命科学领域中的应用。它采用动态液体分析(Dynamic Fluid Analysis™, DFA)技术和声波移液(Acoustic Droplet Ejection,ADE)技术,让研究人员能够移取多种不同类型的液体,完成微量小体积(2.5/25nL)的移液工作。全流程无需枪头耗材,无交叉风险。纳升移液技术让细胞株构建更快、更准、更经济更快—— Echo快速任意孔到任意孔移液,极速基因组装在质粒构建前期,需要非常多的准备实验,如基因组装中将不同的DNA片段混合,在检测反应中将不同的样本组合,在NGS文库构建过程中将多个文库pooling到一起,在CRISPr基因编辑中构建sgRNA文库等等,这些实验都需要进行快速、灵活的加样移液,就算使用高通量的移液工作站,往往也要好几小时才能完成。纳升移液技术Echo的任意孔到任意孔的快速移液特点则让此类应用简单、快速化,每次转移花费更少时间更短。这为基因组装节省了高达82%的时间。从母板任意孔转移任意体积样品到目标板任意孔中,实现快速挑选、样品混合和组合。有效缩短实验周期更准—— Echo加样精 准,提高克隆效率利用质粒上含有的抗性选择进行筛选,需要对筛选结果进行鉴定, 而qPCR也是常用的鉴定方法之一。使用Echo纳升移液技术进行微量化克隆筛选鉴定,可以以更少的实际成本精 准完成实验。使用Echo完成 qPCR的反应体系构建,通过减少每个组件的体积,并使用不使用tips的Echo,将反应体积缩小10倍,从10 μL减少到1 μL,成本降低了8倍。精 准减小实验体积更经济—— Echo微量化,缩小反应体系,让新技术更经济系统化的设计必然会带来更大的样本量,从而导致更高的费用, Echo采用声波的能量进行无接触式移液,且每滴液滴仅为2.5nL或25nL,因此可以直接省去吸头耗材的消耗,也可以将检测反应体系降低4-100倍,使成本急剧下降。有效缩减试剂成本Gibson and Golden Gate Assembly实验:不同反应体积的成本效益和组装效率比较产品信息“仅用于科研,不用于临床诊断”
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2023-01-10 12:42:52贝克曼库尔特Biomek NGeniuS与IDT文库制备自动化解决方案
随着基因组测序和数据分析方法的广泛普及,越来越多的实验室正在探索下一代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)作为研究工具的可行性。然而,NGS文库的手动制备过程单调乏味,根据所构建文库的类型而异,耗时从数小时到数天时间不等,并且操作过程中必须小心谨慎,以避免人工出错导致的制备失败,浪费宝贵样本。Biomek NGeniuS系统是一款全自动文库制备系统,帮助我们从第 一步即确保正确无误。DNA样品上机,拨动转盘,按下按钮,运行过程无需值守,每批次可支持运行4-24任意数量的样品,是实验室追求灵活性和自动化的理想之选。图1 Biomek NGeniuS全自动文库制备系统IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 便是一款支持自动化的试剂盒。该试剂盒提供高一致性的文库制备方法,独特的两步连接法能够有效抑 制接头二聚体和模板DNA自连,因而可有效提高文库转换率,尤其适用于cfDNA和FFPE等低质量样品,有助于研究人员发现和表征肿瘤样品中出现的低频变异位点。图2 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit工作流程我们使用Biomek NGeniuS系统对三种不同类型的样品,cfDNA、FFPE和gDNA,分别构建24个、10个和4个文库。cfDNA 样品所得文库平均浓度为16.67ng/μL。cfDNA样品连接后扩增片段平均长度为362bp,长度分布一致且呈正态。与参考基因组相比,该样品组从NGeniuS实验中获得的所有文库比对率为99.49%,配对的reads比对到参考基因组的比对率为99.84%。23份样品中reads平均重复率为0.46%。图3  以cfDNA为起始样品,在Biomek NGeniuS 系统上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制备文库的分析结果。FFPE样品构建的文库平均片段长度为378 bp,长度呈正态分布。与参考基因组相比,该样品组从NGeniuS实验中获得的所有文库比对率为99.8%,配对的reads比对到参考基因组的比对率为99.84%。10份样品中reads平均重复率为0.37%。图4  以FFPE DNA为起始样品,在Biomek NGeniuS 系统上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制备文库的分析结果。gDNA样品制备的文库平均片段长度为391bp,长度分布与 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 的预期一致。与参考基因组相比,该样品组从 NGeniuS实验中获得的所有文库的比对率为99.2%,配对的reads比对到参考基因组的比对率为99.3%。3份样品中reads平均重复率为0.56%。图5  以gDNA为起始样品,在Biomek NGeniuS 系统上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制备文库的分析结果。在Biomek NGeniuS全自动文库制备系统上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep kit构建文库,所得文库片段大小分布一致,并符合IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit说明书建议的文库大小范围。对三种不同浓度的样品重复进行测序,结果表明,平均文库大小为362~391bp。所获文库比对率>99.2%,配对的reads比对到参考基因组的比对率>99.3%,重复率
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