2025-01-10 10:50:43油菜内源基因
“油菜内源基因”指的是油菜植株自身携带的、控制其生长、发育、代谢等生命活动的基因。这些基因在油菜的遗传信息中起着决定性作用,通过编码特定的蛋白质或RNA分子,调控油菜的多种性状,如产量、抗逆性、品质等。研究油菜内源基因有助于揭示油菜的遗传机制,为油菜的遗传改良和分子育种提供理论基础和基因资源。同时,也有助于理解油菜与环境之间的相互作用关系。

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2023-05-26 09:35:19基因的阴暗面你了解吗
    生命系统的进化从未停止,新事物的出现总是会伴随着旧事物的退出,甚至是消亡,基因正是如此。而任何事物都具有双面性,基因的进化也无法免于俗套。近期,来自麦克马斯特大学、芝加哥大学、巴斯德研究所等的研究人员通过对曾经保护人类免于黑死病的基因进行研究,发现这些基因如今跟克罗恩病、类风湿性关节炎等自身免疫性疾病的易感性增加有关。也就是说,基因的进化并不总是朝着有利的一面,其具有双面性。    传染病是推动人类进化***强大的选择压力之一,包括历史上有记录以来的一次***大死亡事件——第二次瘟疫大流行的爆发,通常称为黑死病,其由鼠疫耶尔森菌引起。这场瘟疫对非洲-亚欧大陆甚至产生了毁灭性的影响,造成多达30-50%的人口死亡,尽管已经过去几个世纪,但其影响似乎至今仍然在蔓延。    黑死病在人类遗传学上留下了持久的印记,改变了塑造我们免疫系统的频率,对于现在的人类来说或许不是一件好事。    为了确定可能在黑死病期间保护人类免于感染及死亡的基因,来自麦克迈斯特大学、芝加哥大学、巴斯德研究所的研究人员对来自黑死病出现之前、黑死病发展期间、黑死病发生之后两个不同欧洲人群的206个古代DNA提取物的免疫相关基因进行了遗传变异的特征。通过一系列研究,他们发现保护性变体与如今自身免疫性疾病易感性增加有关的等位基因重叠,为黑死病在塑造如今的疾病易感性方面所起的作用提供了经验性证据。相关研究成果以“Evolution of immune genes is associated with the Black Death”为题,发表在Nature上。    这项进行了长达七年的研究获取了从伦敦、丹麦出土的三组不同骨骼遗骸中提取的DNA,包括黑死病受害者、黑死病发生之前死亡的人、瘟疫发生后10到100年死亡的人,***终研究人员筛选出516个DNA样本。为了检测可能对鼠疫杆菌具有保护作用或易感性的等位基因,研究人员在候选区域(免疫基因和GWAS基因座)内搜索了在黑死病发生前后DNA样本之间等位基因频率出现极大变化的变体。相对于一组非免疫基因座,高分化位点的免疫基因座强烈富集,暗示了免疫基因的正向选择。      终研究人员锁定了四个基因,这些基因会在病原体入侵人类免疫系统时提供保护,并且发现这些基因中有的等位基因具有保护性有的则使人易感。研究人员所确定的***强关联是rs2549794和ERAP2表达之间的关联,其中保护性等位基因与ERAP2的表达增加5倍有关。***终通过实验发现,ERAP2与***鼠疫杆菌感染的能力之间存在关联性,表明ERAP2与鼠疫菌感染的反应有关,进而支持了黑死病期间ERAP2等位基因频率的变化可能是鼠疫菌诱导的自然选择所致这一观点。      如果一个人携带两个保护性ERAP2等位基因,则其在黑死病发生期间存活下来的可能性将增加40%-50%。因为拥有两份ERAP2基因拷贝的人,其免疫系统能产生更多功能性蛋白质,进而拥有强于拥有一份ERAP2基因的人的识别感染的能力。      但凡事皆有双面性,研究人员发现,鼠疫菌对ERAP2的选择可能会影响对其他病原体或疾病的免疫反应。选择有利的ERAP2变体是如今克罗恩病的风险因素,同时,拥有rs11571319遗传变体的基因CTLA4与类风湿性关节炎、红斑狼疮的风险增加有关。       综上,通过对黑死病受害者和幸存者数百年前的DNA进行分析,确定了帮助人们在瘟疫中幸存下来的关键基因差异。而这些差异继续塑造了今天的人类免疫系统,曾经保护人类免于黑死病的基因如今与更易换上克罗恩病和类风湿性关节炎等自身免疫性疾病有关。基因进化的双面性:成也萧何,败也萧何!       以上研究分析了黑死病发生期间对基因产生了一定影响,而这影响至今仍有所体现,说明基因的选择性进化具有双面性。      无独有偶,一项发表在Nature Reviews Genetics上,题为“The transition to modernity and chronic disease: mismatch and natural selection”的研究表明,现代化带来了一个完全有别于过去的环境,与以往环境具有更高适配性的基因,在现代生活中未必也是如此,甚至可能会使人更易患病,比如阿尔茨海默症、癌症以及心血管疾病。      在现代化进程中,人类进化的能力与快速变化的环境之间出现了不匹配,对人类健康产生了很大影响。由拮抗多效性(指的是能同时具有有利和不利影响的基因)介导的先前进化的遗传效应现在可能占非传染性疾病负担的很大部分,目前这些疾病造成了世界上超过63%的死亡。       威廉姆斯提出,衰老是由许多基因的综合作用引起的,这些基因具有多效性,也就是说其在年轻时带来好处但在年长时会付出代价。已经有几项研究提供了直接及间接证据,表明与老年疾病风险增加相关的基因与青少年存活率、生育能力及繁殖成功率增加有关。       RNA提取磁珠属于纳米生物磁珠的一种,主要作用是用于核酸提取过程中的RNA提取,粒径分布在500nm左右,是洛阳吉恩特生物自主研发生产的高分子纳米磁性微球,该磁珠悬浮时间长,磁响应时间迅速,对DNA甲基化过程中的提取环节提供良好的支持,可明显缩短实验时间,提高实验效率,并在提取结果上保持稳定,配合核酸提取仪,更能实现快速的RNA提取。
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2023-05-16 09:54:10【病例研究】眼部基因治 疗视网膜下注射
术中光学相干断层扫描(OCT)辅助下Leber先天性黑矇(LCA)黄斑修复术病例研究的内容Leber先天性黑矇(LCA)是一组先天性视网膜营养不良,可导致早年出现重度视力损伤。患者通常表现为眼球震颤、瞳孔反应迟钝或近乎缺失、视力严重下降、畏光和高度远视[1]。眼部基因治 疗可极大改善这些患者的视力[2]。通过术中视网膜下注射AAV载体完成基因传递。视网膜下眼部基因治 疗注射对准确度水平有较高要求。因此,术中光学相干断层扫描(OCT)是一项必不可少的工具。术中OCT可向眼科医生提供实时信息,支持气泡管理,并可用于确认预期的载体量是否到达视网膜下间隙。术中OCT还有助于预防并发症,例如载体注射期间术中形成的黄斑裂孔。病例研究中值得期待的内容学习要点了解21岁视网膜变性及2型Leber先天性黑矇(LCA)患者的手术治 疗发现视网膜下眼部基因治 疗注射的不同步骤理解术中OCT在黄斑修复术中的作用眼部基因治 疗病例描述1例21岁西班牙裔女性,自出生以来视力不良,包括夜盲症、视野收缩、视力下降和色觉下降。患者注意到出现缓慢的进行性功能性退减。尽管已完成高中学业,但她的方向感日益恶化,并且由于视力限制无法独立生活和工作。图1:图注:黄斑OCT和超宽视野眼底图像显示基线色素性视网膜病变和相对保留中央凹的感光器改变。图像由A博士提供诊断与术前评估双眼术前视力均为20/150。患者表现为典型弥散性视网膜变性,黄斑相对保留。基因检测显示双等位基因RPE65变异导致视网膜变性,并提示2型Leber先天性黑矇。鉴于可获得视网膜活细胞且考虑到眼部基因治 疗的潜在受益,对双眼进行了视网膜下注射治 疗。两次手术之间间隔两周。黄斑OCT和超宽视野眼底图像显示基线色素性视网膜病变和相对保留中央凹的感光器改变。图2:进行黄斑扫描以记录注射前解剖结构,图像由A博士提供扫码下载完整版【病例研究】(英文)
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2023-05-30 10:12:19【白皮书下载】术中OCT辅助基因治 疗(英)
术中OCT提高视网膜下基因增强治 疗的手术安全性和治 疗准确性基因增强治 疗是一种眼部基因转移方法,用于治 疗当功能蛋白不足表现为遗传病时的常染色体隐性或X性染色体连锁视网膜营养不良。这些基因缺陷引发特定视力障碍和/或视网膜变性。近期,基因治 疗在视网膜营养不良中的应用引发了人们巨大的兴趣。视网膜下基因治 疗药物注射术的技术要求较高,具有一定难度。术中光学相干断层扫描(术中OCT)可提供实时信息并向外科医生提供反馈,包括对眼后段结构的渗透深度、注射液的分布和传播、载体回流以及术中黄斑中心凹的完整性。扫码下载完整英文白皮书您是否想要进一步了解视网膜下基因治 疗药物注射术治 疗视网膜营养不良?输入您的信息后可下载完整白皮书。
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2023-02-23 09:07:02科学家揭示人类特有高清视觉的基因秘密
       荣登封面的这项研究成果来自哈佛***神经科学家Joshua Sanes教授领衔的科学家团队。研究人员采用高通量单细胞基因测序的方法,创建了灵长类动物的视网膜细胞型态分类图谱,揭示为我们带来敏锐视觉的细胞有哪些特殊的基因特征。这项研究同时为理解人类视觉在疾病情况下如何被破坏提供了重要的基础。      凹:让我们看得清清楚楚明明白白真真切切人类的视觉在哺乳动物中出类拔萃,比如我们能够阅读,分辨人脸。这些功能可不简单,需要视觉能够分辨极细微的差异,并能迅速对焦。高清视觉全得归功于视网膜中间一个极小的特殊区域——***凹,也就是眼底黄斑的中心。凹的直径不到1.5毫米,面积只占视网膜的不到1%,但大脑获得的视觉信息却有50%来自这里。     凹的特殊,还不仅是因为视线的“焦点”落在此处提供清晰影像,要知道哺乳动物中只有部分灵长类生物进化出了这个结构,比如人类。▲“那(fovea)是个稀罕物,岂是什么生物都能有的?”      凹为人类提供了视力的同时,却让科学家在解决人类视觉疾病时面临一个难题。就拿实验“劳模”小鼠来说,虽然它们为人类的科学研究提供了无数疾病模型,但它们“鼠目寸光”,视网膜没有***凹!这种 “先天缺陷”让它们在视觉相关疾病的模型上帮不上什么忙。再加上***凹结构太微小了,过去科学家在灵长类动物上的研究也止于形态解剖学的描述。     终,他们在凹和外周视网膜中均鉴定出了近70种不同类型的细胞,并且还知道了每一个类型的细胞表达哪些基因。      详尽的细胞分类图谱给科学家们提供了许多过去不知道的信息。用Sanes教授的话说,“我们现在弄清楚了凹特别在哪里。”▲凹的细胞和外周视网膜类型相似,但组成却不同        尽管细胞类型九成相同,但***凹和外周视网膜的细胞类型组成不同。更关键的是,在同类型的细胞中,***凹处的细胞检测到表达与外周不一样的基因。非常有意思的是,这些基因的表达和***凹独特的视觉信息处理极为相关,科学家们相信,可能这才是***凹功能特殊的原因。       核酸提取产品对细胞筛选的方法已日渐成熟,原理是将包被一抗的磁珠与细胞表面对应的分子特异性结合,或者将包被二抗的磁珠与已经与细胞表面分子特异性结合的一抗结合。核酸提取磁珠携带与之结合的细胞吸附与分离柱或试管上,实现阳性细胞或阴性细胞的分离。洛阳吉恩特生物自主研发生产了各类核酸提取磁珠,可以实现稳定的实验结果。
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2023-04-11 09:07:10日有所思夜有所梦?Cell子刊揭示:做梦的关键基因
      做梦——人在睡眠时自然发生的一个过程。来自日本理化学研究所的科学家发现,做梦这件事归功于Chrm1 和 Chrm3 两个关键基因。当敲除这两个基因时,人在快速眼动(REM)睡眠期的睡眠水平会下降,且不再做梦、记忆减退。人在睡觉过程中,脑电图会发生各种随着睡眠深度不同而不同的变化。根据脑电图的不同特征,睡眠分为两种状态:非眼球快速运动睡眠(NREM睡眠)和眼球快速运动睡眠(REM睡眠),梦境通常发生在REM睡眠期。      此前研究表明,乙酰胆碱受体(可产生副交感神经兴奋效应,即心脏活动、消化腺分泌增加、瞳孔缩小等)参与了REM睡眠的调节,为了揭示REM睡眠背后的分子机制,在***新一项研究中,通讯作者Hiroki Ueda及其团队在小鼠模型中实验了胆碱能神经元,这种神经元布满乙酰胆碱受体。DOI:http://www.giant-bio.com/home-newsinfo-id-4263.html在发表于《Cell Reports》杂志上题为“Muscarinic Acetylcholine Receptors Chrm1 and Chrm3 Are Essential for REM Sleep”的这篇文章中,研究人员首先通过突触抑制这些神经元来识别对睡眠至关重要的神经元群体。之后使用CRISPR基因编辑技术系统地禁用乙酰胆碱受体基因。       让人意外的是,当敲除了乙酰胆碱受体基因Chrm1和Chrm3后,他们发现,REM睡眠期几乎丧失,而失去了这一睡眠阶段也就意味着不再产生做梦现象。       另一方面, NREM睡眠可分为I、II、III、IV四个阶段,其中I、II期称“浅睡眠”,III、IV期称为“深睡眠”。II期非快眼动睡眠期占总睡眠时间的50%左右。研究人员据此认为该实验中小鼠睡眠时间的缩短或是由于NREM睡眠时间缩短造成,这就表明,胆碱能调节对NREM睡眠也很重要。通过进一步研究,作者继而得出,REM睡眠受损也会缩短NREM睡眠的持续时间。      一般来说,当REM睡眠出现障碍时,会出现一系列问题,如精神压抑、过度饮酒、脑血管疾病和变性性神经系统疾病等。然而在这项研究中,作者们观察到,当广泛分布于不同大脑区域的Chrm1和Chrm3基因被敲除时,尽管小鼠几乎完全不再经历REM睡眠,但仍然存活了下来。        作者、RIKEN研究员Yasutaka Niwa说:“令人惊讶的发现是,尽管REM睡眠几乎完全丧失,小鼠还是可以存活的,这将使我们能够严格验证REM睡眠是否在学习和记忆等基本生物功能中发挥了关键作用。”总结来说,这些发现强烈暗示Chrm1 和 Chrm3基因对梦境以及睡眠调节的重要性,尤其是对REM睡眠发挥的作用。        生物磁珠对细胞筛选的方法已日渐成熟,原理是将包被一抗的磁珠与细胞表面对应的分子特异性结合,或者将包被二抗的磁珠与已经与细胞表面分子特异性结合的一抗结合。磁珠携带与之结合的细胞吸附与分离柱或试管上,实现阳性细胞或阴性细胞的分离。洛阳吉恩特生物自主研发生产了各类生物磁珠,可以实现稳定的实验结果
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