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5个步骤掌握FISH技术:高效探索微生物世界

来源:长春长光辰英生物科学仪器有限公司 更新时间:2024-04-23 20:15:04 阅读量:177
导读:荧光原位杂交技术(FISH)是一种强大的分子生物学工具,它允许研究者在保持细胞形态完整的条件下,检测和定位特定



荧光原位杂交技术(FISH)是一种强大的分子生物学工具,它允许研究者在保持细胞形态完整的条件下,检测和定位特定微生物群落中的核酸序列。这项技术通过使用带有荧光标签的特异性探针,使得目标微生物在复杂的环境样本中得以可视化。FISH技术的应用范围广泛,包括但不限于生物被膜研究、环境微生物组成分析、以及微生物代谢机制的探究。

与传统的分离培养方法相比,FISH技术能够在原位条件下进行,避免了因培养条件改变而导致的微生物生理状态和代谢特性的变化,从而更真实地反映微生物在自然环境中的状态。此外,FISH技术还可以与其他技术如拉曼光谱(Raman)和激光诱导向前转移(LIFT)技术联用,进一步提升微生物研究的深度和广度。


FISH技术的实验方法





第一步:准备目标基因对应的探针

在进行FISH实验之前,首先需要设计并合成与目标微生物的特定基因序列互补的探针。这些探针通常带有荧光标签,以便在显微镜下进行可视化。


第二步:探针变性

对于双链DNA探针,需要在实验前进行变性处理,将其转换为单链形式以便与目标序列进行杂交。这一过程通常在70℃-80℃的条件下进行约10分钟,随后迅速冷却以防止探针重新形成双链。


第三步:样品制备

样品的固定是FISH实验中的关键步骤。通常使用4%的多聚甲醛作为固定液,以保持细胞的形态和结构完整性。固定后的样品需要经过一系列的脱水步骤,通常使用50%、80%和100%的乙醇进行处理。


第四步:杂交

在样品脱水后,滴加含探针的杂交液,并在湿盒中进行恒温杂交,时间一般为1-3小时,温度根据探针的设计选择在37-46℃之间。如果需要进行预杂交,可以先使用不含探针的杂交液进行处理,以减少非特异性结合。


第五步:洗脱

杂交完成后,使用预热的清洗液进行漂洗,以去除非特异性杂交的探针。随后使用超纯水清洗并吸干样品,然后进行荧光显微镜下的观察。

实验小贴士

清洗液的pH值应保持在7左右,以避免对分选芯片介质造成损害。
在实验过程中,应严格控制温度和时间条件,以确保杂交的特异性和效率。
根据实验目的和样品类型,可能需要对上述步骤进行适当的调整和优化。

FISH-LIFT 工作流程




FISH标记


荧光显微观察


LIFT分选


测序

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END


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