SCIEX学堂系列课程 | 质谱及数据的底层逻辑

带您了解质谱图中的基础概念，包括质谱仪器的种类及各自的工作范围；元素的同位素分布及在质谱中的表现；质谱图的基本特征等内容。

通常我们做质谱分析有三类目的，定量、定性表征、大数据分析，不同的分析目的，我们所用的仪器或者仪器性能要求是有差异的，我们将在此章节给大家详细介绍基于分析目的的仪器选择和实验设计问题。

质谱的主要硬件包括离子源、接口、质量分析器以及检测器等部分。常用的离子源又包括GCMS常用的EI 硬电离离子源 和液质常用的 API 大气压离子源，包括ESI 和APCI ;常见的质量分析器包括四极杆、离子阱、飞行时间质谱以及质量分析器的联用技术；我们将在此章节给大家详细介绍仪器的硬件设计及功能，以及这些设计在质谱方法参数上的体现。

进行一个完整的方法开发需要考虑液相条件、质谱参数，包括选择合适的电离模式、离子源参数、化合物参数等；若是高分辨的仪器，我们常设的质谱采集模式是信息依赖采集（IDA）或者信息非依赖采集(SWATH)，我们将在此章节给大家介绍液相条件的优化、质谱采集模式的选择，以及如何最后形成灵敏而稳定的LCMS方法的工作思路。

我们要做好数据处理工作，需了解数据处理的的算法，包括平滑、峰的判断、信噪比的计算、IDA的判定、线性拟合的算法及积分参数等；通过合适的数据处理方法才能将原始数据转化为最终的报告数据。

我们将介绍软件数据处理的逻辑，以及主流质谱数据处理软件界面：如Analyst、 OS 等；

想要得到好的数据，我们需做好仪器的维护操作。除了日常的液相和质谱的维护以外，我们还需要关注实验室的温湿度、气体的来源和废气排放、试剂的选择和流动相的配制、仪器真空状态的判断和维护、机械泵的维护等；