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跨越障碍：如何克服FISH标记在基因组测序中的局限性

发布：长春长光辰英生物科学仪器有限公司

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在探索微生物群落的复杂性和功能性时，荧光原位杂交技术（FISH）为我们提供了一种强大的工具。这项技术通过使用带有荧光标签的特异性探针，使得研究者能够在保持细胞形态完整的条件下，检测和定位特定微生物群落中的核酸序列。FISH技术的应用范围广泛，从生物被膜的研究到环境微生物组成的分析，再到微生物代谢机制的探究，都发挥着不可替代的作用。然而，在实际操作过程中，研究者常常会遇到一些技术和应用上的挑战。本文将针对这些常见问题进行解答，帮助研究者更精准地运用FISH技术，以期达到更深入的科学探索。

FISH技术在应用中的常见问题

common problem

FISH标记的微生物拉曼光谱能够检测吗？

由于荧光信号强度通常是拉曼信号的106-108倍，因此如果一束激发光同时激发出了样品的荧光和拉曼光谱信号，拉曼信号会被荧光所掩盖，导致无法获取。因此，在探针选择上，其激发波长应尽量避开拉曼检测激光波长。此外，在拉曼检测前，使用激光照射的方法使FISH的荧光信号淬灭，从而显现出样品本身的拉曼信息。

FISH标记有什么局限性吗？

FISH标记在对细菌群落组成探究以及功能基因标记可视化上并没有太多局限，但在后续进行基因组测序过程中可能需要对染料标记的细胞进行额外的处理步骤。因为部分的FISH染料残留物可能会对DNA质量和纯度产生影响，并可能干扰扩增反应。因此，在进行基因组测序之前，可能会需要进行如洗脱染料或纯化DNA等步骤，以确保获得高质量和干净的DNA样品。

荧光单细胞分选仪支持几种FISH荧光标记？

目前的PRECI SCS-F荧光单细胞分选仪搭载4个通道，涉及红黄蓝绿四色染料，标配激发光波长包括紫外光波长、488nm、550nm、650nm，能够涵盖市面上大部分常见的荧光染料，也可根据客户需求进行激发与发射波段的定制。PRECI SCS-F很好地匹配了FISH的多重标记优势，结合智能图像识别算法，可同时根据2-4种FISH荧光标记特征及明场形态学特征对目标微生物进行自动化识别与精准分离，目标菌得率≥99%。

产品链接：PRECI SCS 微生物单细胞分选仪 (qq.com)

希望能够为使用FISH技术的科研人员提供实用的指导和帮助，以便大家能够更有效地解决实验过程中遇到的问题，从而更好地理解和揭示微生物世界的奥秘。

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