PicoPLEX WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒常见问题

1.推荐加样量

1-10个人类细胞（如：卵裂球，极体，滋胚层细胞，羊水细胞，循环肿瘤细胞，培养细胞）

1000-10000个细菌细胞

不完整或片段化，单/双链DNA

2.PicoPLEX单细胞全基因组扩增试剂盒推荐应用？

PicoPLEX单细胞全基因组扩增试剂盒用于：

CNV拷贝数变异：寡核苷酸和细菌人工染色体的微阵列比较基因组杂交（oligonucleotideandBACaCGHa）

单核苷酸多态性分型SNP

PCR法基因突变筛查

3.使用PicoPLEXWGAKit前，可以用什么缓冲液洗涤单细胞？

一些客户成功使用加了PVA（聚乙烯醇，例：0.1%）的PBS洗涤收集细胞。另外，注意洗涤/收集缓冲液（PBS）不要含钙、镁离子。

4.流式分选有什么特殊要求吗？

Yes,westronglyrecommendnotfixing,andusinglightscatteringorphasecontrasttosortorcollectsamples.Microscopic/visualconfirmationofsuccessfullysortedcellscanbeusedtooptimizesortingconditions.

5.PicoPLEXWGAKit的加样体积？

每次反应5μl加样体积（细胞和缓冲液总体积不超过2.5μl）。

6.单细胞全基因组扩增产物能直接用于NGS吗？

不能。

3.那么有其他能直接应用NGS的单细胞全基因组扩增试剂盒吗？

有。PicoPLEXDNA-seq直接应用IlluminaNGS。

8.WhatistheexpectedgenomiclocusrepresentationandLossofHeterozygosity(LOH)forPicoPLEXWGAproducts?

Forreferencepurposes,seethedataobtainedfromathirdpartyinthetablebelow.

SNPGenotypingMethod

Single-CellAmplificationSuccessRate

SNPCallRates

LOH

PCR

95%

>95%

<10%

IlluminaInfiniumSNParray

95%

50%60%

7%12%

9.单细胞全基因组扩增技术的终产物是单链还是双链DNA？

产物是单双链DNA的混合物。

1.WhataretherecommendedDNAinputsforthePicoPLEXWGAKit?

110humancells(e.g.blastomeres,polarbodies,trophoblasticcells,amniocytes,CTCs,culturedcells

1,00010,000bacterialcells

Intactorfragmented,single-ordouble-strandedDNA

2.WhatapplicationsarerecommendedforPicoPLEXWGAKit?

Thiskitisusedfor:

Copynumbervariation(CNV)analysis:superiorforoligonucleotideandBACaCGH（BacterialArtificialChromosomeArray-basedcomparativegenomichybridization）

SNPgenotyping

MutationdetectionbyPCR

3.Isthereanon-stickwashbufferthatcanbeusedforsinglecellwashpriortousingPicoPLEXWGAKit?

ThishasnotbeenvalidatedatRubiconGenomics,butsomecustomershavesuccessfullyusedPVA(PolyvinylAlcohol;e.g.0.1%)inPBStowash/collecttheircells.Additionally,yourwashing/collectingbuffer(PBS)mustbealsoCa-andMg-free.

4.Aretherespecialrequirementsforflowsorting?

Yes,westronglyrecommendnotfixing,andusinglightscatteringorphasecontrasttosortorcollectsamples.Microscopic/visualconfirmationofsuccessfullysortedcellscanbeusedtooptimizesortingconditions.

5.WhatisthesampleinputvolumeforPicoPLEXWGAKit?

Thiskitwillaccommodatea5μlsampleinputvolumeperreaction(withamaximumof2.5μlofcell&buffercarryover).

6.CantheproductofPicoPLEXWGAKitbetakenstraighttoNGS?

No.

7.DoesRubiconGenomicshaveanNGS-readykitforsinglecellapplications?

Yes,PicoPLEXDNA-seqcanbeusedwithIlluminaNGSplatforms.

8.Sigma-AldrichsellsaGenomePlexWGAkit,isitthesametechnologyasPicoPLEXWGA?

No,PicoPLEXusesdifferenttechnology.

9.WhatistheexpectedgenomiclocusrepresentationandLossofHeterozygosity(LOH)forPicoPLEXWGAproducts?

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Single-CellAmplificationSuccessRate

SNPCallRates

LOH

PCR

95%

>95%

<10%

IlluminaInfiniumSNParray

95%

50%60%

7%12%

10.Istheproductofthistechnologysingle-ordouble-stranded?

TheendproductofPicoPLEXWGAisamixtureofsingle-anddouble-strandedDNA.

PicoPLEXWGAKit单细胞全基因组扩增试剂盒问答英文版摘自Rubicon，中文版由红荣微再翻译整理。

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RB3050RubiconPicoPLEXWGAKit单细胞全基因组扩增试剂盒

PicoPLEXWGAKit采用ZL技术，设计优化用于从单细胞中扩增全基因组DNA。起始样本量低至单细胞或6pg基因组DNA。便捷的单管操作流程降低污染节省时间。结果稳定性、重复性好。

PicoPLEXWGAKit适用arrayCGH分析和PCR平台。PicoPLEX技术被IVF供应商如BlueGnome信赖并用于PGS，BlueGnomeCGH也是ZG福利会国际和平妇幼保健院所用的PGS平台。

产品订购信息

货号

产品名称

包装

RB3050/R30050

PicoPLEXWGAKit单细胞全基因组扩增试剂盒，arrayCGH、PCR分析用

50次反应

RB3381/R300381

PicoPLEXDNA-seqKit，48种双端illumina引物

48

红荣微再（上海）生物工程技术有限公司以“传递科学价值，服务科学研究”为宗旨，主营：干细胞、极ng准YL、细胞ZL、器官再生四大板块的产品。

红荣微再极ng准YL宣传册

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