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晶体日记(六):一颗怕冷的晶体
发布:束蕴仪器(上海)有限公司浏览次数:2低温环境下测单晶现在不同于以前,液氮低温下测单晶,在很多时候都是标配。因为在液氮低温的Freeze下,很多脆弱的晶体才能变得稳定,安静地待在那里经受X射线的照射,让我们能够采集到数据。即便是稳定的晶体,使用低温收集数据,原子的热振动降低,不仅衍射能力增强,很多时候还能避免后续一些结构精修的烦恼,比如无序。在液氮几乎白菜价的现在,我们巴不得每个晶体都在低温下享受一下速冻。
But,如果盲目的认为低温收数据就一定好,如同很多单晶科学里传的似乎板上钉钉的谣传一样,那你也许会错过很多科学发现,甚至“抱憾终生“。有人抗热,有人抗冷。晶体也是一样,并不是所有的晶体都适合承受液氮的寒冷,也许冻住了就变身了。我相信很多同学都遇到过类似的情况,晶体长的很漂亮,但是低温下测试都没有什么衍射。我们通常会认为这是由于晶体内部的结构堆积的周期性太差,徒有其表。很少有人去怀疑晶体在低温下会挂掉。当然这种情况并不常见。
实验发现去年的时候做了一个非常有意思的晶体,虽然这是一个美丽的失误,但是却发现了更很有意思的事情。显微镜下这个晶体长得晶莹剔透,像极了一块块冰糖(为什么不是宝石,自己脑补…)。晶体起初被认为是一颗超分子的晶体,然而初始的衍射图却有些让人不解。虽然晶体的衍射能力很强,但是衍射点的排列却有些让人无语,完全不像是单晶的样子,也不应该是一个超分子的晶体所具有的晶胞大小的衍射图。
问题一:是什么?
衍射图如此,也就没有什么希望得到准确的晶胞参数,更没有必要继续做下去。几乎可以断定的是这不会是目标的超分子晶体,但是总有人诡辩说”万一”呢?好吧,实际上是强烈的好奇心在驱使着我去一探究竟。这到底是什么,又究竟是为什么会发生这种现象。
实际上这个问题并不难解决,因为晶体在显微镜下是晶莹剔透的“冰糖”,而在上样之后就没那么透彻了,变得朦朦胧胧。对于一颗这么好看的晶体来说,这显然是发生了什么。于是步骤一操作,关掉低温。此时晶体仍然保持着透明的状态,衍射图变得异常的清晰起来,这个一定是一颗salt crystal。至于为什么,请初学者自行补课。▲图1 低温和室温的不同衍射图
我们很顺利的定出了晶胞参数,一颗立方F晶系的盐。至于是什么,APEX4 会给出大致的答案。▲图2 Determine Unit Cell and Search
作为晶体中,可能会加入的抗衡离子,KPF6(六氟磷酸钾)是那么的突出。知道了元素,结构解析,也就顺利地确定这个晶体是KPF6,▲图 3 KPF6 的结构
那么这里问题一就基本解决了。
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问题二:发生了什么?
显而易见,晶体并不是被冻碎了,而是整个物相都发生了变化。随着温度的降低,晶体经历了三种不同的物相。在DIFFRACT.EVA 中可以轻松地分析得到可能的物相。但是有意思的是对于KPF6的物相和相变温度一直以来却有着争论。关于KPF6的相变,可以检索到很多文章:咦?我是不是错过了什么…..2022-03-25相关仪器 -
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