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水稻基因组常用酶平均酶切后平均片段大小是多少

零度右手 2017-02-01 07:39:15 490  浏览
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全部评论(1条)

  • af05522 2017-02-02 00:00:00
    基因组测序涉及DNA的大规模测序,由于目前只能采取分而治之的测序基本策略,即将基因组DNA分割成一定大小的片段,然后分别对这些片段进行测序。而遗传图和物理图可作为整个基因组测序的路标,为小片段DNA测序和重叠群构建提供了基础。 已获得高密度水稻遗传连锁图,为何不能直接指导基因组计划的测序,还要绘制物理图?其主要原因是遗传图的精确性较低、分辨率有限,而物理图是对遗传图的进一步深化,并能直接应用于图位克隆技术分离目的基因。1998年,Umehara等构建了水稻diyi张物理图谱,共筛选到5701个YAC,其中2117个单一YAC分配到12条染色体上,跨度216Mb,覆盖水稻基因组的50%。接着日本水稻基因组计划(RGP)开始将YAC重叠群(contig)分解成粘粒(cosmid)DNA克隆,构建更精细的物理图谱。2001年,RGP还构建了一个覆盖270Mb(全基因组的63%)的YAC文库的物理图,由6934个YAC组成,插入片段平均长度为350kb。

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