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- 拾惠金秋 2017-06-08 00:00:00
- 深蓝算法与常用的暗像元算法类似,不同的是,与暗像元算法 相比,深蓝算法反演气溶胶光学厚度适用于更广泛的地表类型,所能反演的像 元的地表反射率远高于暗像元算法限定的Z高地表反射率。Hsu 等发现,在高 地表反射率地区,红(0.66μm)、蓝(0.47μm)和中红外波段地表反射率之 间的线性关系不成立。 相比较与陆地浓密植被地区,沙漠和半沙漠地区的地面 BRDF(双向反射率分布函数)相对较弱,尤其是蓝波段Z弱。参考典型地物 标准波谱数据,在深蓝(412nm)波段,大部分地物的地表反射率都在 0~0.1 之间,明显低于其它波段。通过 MODTRAN 等相关辐射传输模拟大气辐射传 输过程进行敏感性试验表明:传感器在天顶位置接受到的包含气溶胶的大气表 观反射率和仅包含大气分子散射时的表观反射率相比,412nm 波段的信号差别 Z为明显。这主要是因为在紫外波段气溶胶吸收将减弱了卫星传感器接收到的 信号强度,而在更长的可见光及红外波段较高的地表反射率成为表观反射率的 主要贡献成为,从一定程度上减弱了卫星传感器接收信号对气溶胶吸收和散射 的敏感性。并且当卫星观测天顶角较大时,由于大气散射路径的延长,减小了 地表反射率影响,此时 490nm 波段的辐射亮度值与 412nm 波段差别非常小。 此外深蓝波段分子散射和吸收都小于紫外波段,因此相比于紫外波段,利用深 蓝波段反演气溶胶光学特性受气溶胶垂直廓线的影响显著偏低,因此利用深蓝 波段卫星观测的表观反射率反演气溶胶光学厚度是一个行之有效的方法。 多星协同反演算法:为克服气溶胶反演过程中未知参数较多,亮地表气溶 胶信息难以从卫星信号中分离出来的困难,唐家奎等提出了基于 TERRA 和 AQUA 双星的 MODIS 数据的协同反演算法,双星协同反演算法无需事先假定 气溶胶类型等参数,无须估算地表反照率,而将地表反射率与气溶胶同时反演, 可以应用于水体、城市、干旱等各种地表反射率类型。但是该算法在气溶胶光 学厚度反演时局限性较大,如难以求得方程解析解、计算速度慢,而且有些象 元可能会出现不收敛或结果误差较大等问题。
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TaqMan探针法因其良好的特异性以及可多重检测而受到实验人员的青睐,其实除了探针法外,还有很多好的实验方法也被实验人员广泛认可,这次就介绍一下另一个应用广泛的方法:SYBR Green染料法,它又是因为哪些优点获得实验人员的青睐呢?
染料法原理
染料法一般使用的是SYBR Green I染料,这是一种可以与双链DNA小沟结合的荧光染料,其不会与单链DNA结合,且在游离状态下几乎无荧光,只有与双链DNA结合才会发出荧光,因此将PCR扩增产生的双链DNA数量与荧光强度直接关联,产生实时监测的效果。
SYBR Green染料法优点
☑ 通用性好,适合进行大多数类型的定量反应,可以进行熔解曲线的分析。
☑ 无需设计探针,引物设计相对简单,不用考虑基团选择,易于上手;成本低,无需合成探针。
☑ 无需PCR后处理,减少分析工作量并节省材料成本。
SYBR Green染料法缺点
SYBR Green染料法也有其缺点,SYBR Green染料法一个反应只能检测一个基因,无法进行二重甚至多重的实验。同样的相对于TaqMan探针法其特异性较差,当引物存在二聚体或者非特异性扩增时,染料同样可以结合并发出荧光,影响定量结果。因此对于SYBR Green染料法而言,设计一套好用的引物是重中之重。
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设计好引物后,我们该怎么进行实验呢?
1.实验条件的优化
我们需要对设计的引物扩增效果进行分析,使用阳性模板进行扩增,确定扩增产物为单一条带,且大小符合设计预期,如有条件可以对扩增产物进行测序,保证准确性。当引物无问题后,进行反应条件的探索,对退火温度进行温度梯度检测,找到合适的退火温度,即PCR扩增效果好,阴性模板无扩增,条带单一,熔解曲线单峰等。
2.预实验
设计好引物并探索好实验条件后,对样本进行一次预实验,预实验将样本进行梯度稀释用以制作标准曲线,分析内参基因以及目的基因的扩增效率是否接近且在100%左右,其次可确认高浓度模板中是否有yizhi剂干扰,从而确定实验时合适的模板浓度(样本是否需要稀释或浓缩)。
3.正式实验
当我们完成了实验条件和预实验后就可以进行正式实验了,每个样品都需要3个或以上的重复,保证结果的准确性。
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