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做实时定量pcr需要哪些试剂?

刚刚学C 2011-08-18 15:34:39 628  浏览
  • 我想先从人血液中提取mRNA,然后逆转录成CDNA,Z后做实时定量pcr,这个过程需要哪些试剂盒或者试剂,请稍微讲详细一点,新人做实验,谢谢!!!

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全部评论(3条)

  • adsfdsfscz 2011-08-31 00:00:00
    1.提取mRNA所需试剂: (1)Trizol,很多公司都有卖的,可以看你们实验室经常购买的公司是哪种,问公司技术员; (2)异丙醇、无水乙醇、氯仿; (3)RNase-free水,或DEPC处理水; 2.逆转录所需试剂: 一般使用现成的逆转录试剂盒,要实时定量PCR专用的。TAKARA公司的DRR036和DRR037就不错。 3.实时定量PCR所需试剂: 使用现成的实时定量PCR试剂盒。TAKARA公司和TOYOBO公司都有很多种,具体的要看你的实验要求,可以咨询对应公司技术员。

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  • Fiend丶影 2011-08-19 00:00:00
    血液里面提RNA好像是要用试剂盒 反转录的话要反转录酶,OligoT,buffer,RNA酶YZ剂,DEPC水, real time的话要mix和 sybergreen

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  • zky914 2011-08-22 00:00:00
    说一下自己做实验时候用到的东西,血液提取mRNA还是采用试剂盒来提取,手工法极不推荐,但是试剂盒还是蛮贵的,可以问一下天根公司,价格还算可意 ,效果也不错。逆转录过程可以用Fermentas一款逆转录试剂盒,实时定量我们都是用Invitrogen的实时定量试剂,我们学校做实时因为是收费的,所以 本人还用过一阵子Takara的实时荧光试剂盒,循环时间比较短,效果也不错,就是比较贵。以上都是本人做实验时用到的,性价比应该还是蛮高的,希望能给你些帮助

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做实时定量pcr需要哪些试剂?
我想先从人血液中提取mRNA,然后逆转录成CDNA,Z后做实时定量pcr,这个过程需要哪些试剂盒或者试剂,请稍微讲详细一点,新人做实验,谢谢!!!
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DBI-2223    Bestar® one step RT qPCR kit ( SybrGreen )    
DBI-2224    Bestar® one step RT qPCR kit ( SybrGreen )    
DBI-2225    Bestar® one step RT qPCR kit ( SybrGreen )    
DBI-2226    Bestar® one step RT qPCR kit ( Taqman Probe )    
DBI-2227    Bestar® one step RT qPCR kit ( Taqman Probe )    
DBI-2228    Bestar® one step RT qPCR kit ( Taqman Probe )    
DBI-2231    Bestar® HRM Master Mix    
DBI-2232    Bestar® HRM Master Mix    
DBI-2233    Universal qPCR Mix (Taqman probe)    
DBI-2234    Universal qPCR Mix (Taqman probe)    
DBI-2235    High-throughput qPCR Mix (Taqman probe)    
DBI-2236    High-throughput qPCR Mix (Taqman probe)

包装规格:

25 ml    
5 ml    
1 ml    
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200 Reaction    
100 Reaction (50uL)

荧光定量PCR试剂

产品优势:本生生物代理实验室R耗材品种全,可替代仪器原厂耗材,性价比高,质量稳定,对用户可以节省实验成本。

适应客户:医院检验科PCR实验室,验室;第三方检测机构,科研院所,大专院校,制药厂,试剂生产厂家,疾控,检验检疫。

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一文知晓PCR,定量PCR,数字PCR方法选择

从1985年至今的30多年时间里,PCR分析经历了三代技术的发展。DY代传统PCR技术,采用琼脂糖凝胶电泳的方法对PCR产物进行定性分析。第二代荧光定量PCR技术,通过在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的积累实时监控PCR进程,ZH用Cq值对基因进行定量分析。第三代数字PCR技术,通过将PCR反应液进行有限稀释,实现核酸分子的单分子扩增,ZZ采取终点法检测阳性微滴的荧光信号,有荧光信号的微滴判读为 1;没有荧光信号的微滴判读为 0,因此该技术被称为数字PCR。

PCR技术在不断地蜕变却从未淡出我们的视野,如今已经渗透到分子生物学领域的各种研究层面。尤其在今年大流行疾病中,展现了PCR技术的强大之处。那在科学研究中,我们该如何选择传统PCR 、荧光定量 PCR与数字 PCR呢?

首先我们要清楚,三代PCR技术所有的基础源于PCR反应的基本原理和PCR反应的3个重要阶段,分别是指数期、线性期和平台期。

指数期

指数期内,每个循环PCR产物量大约增加1倍(假定 100%反应效率),该阶段的扩增反应具有高度特异性和精确度。

线性期(高变异性)

随着PCR反应体系成分的消耗,其中的一个或者多种成分限制反应,导致反应开始减缓,并且每个循环的PCR 产物不再加倍。

平台期

反应停止,不再产生更多的产物。因为每个样品具有不同的反应动力学,所以每个反应将在不同的时间点进入平台期,平台期内可以看到这些差异。

传统 PCR

传统PCR通过琼脂糖凝胶电泳对PCR终产物进行分析(图2),它的局限性就在于只能做定性分析。在图3中,3个反应孔含有相同量的 DNA模板,但到达平台期后产生的荧光信号却不同,说明扩增产物的量存在不同(反应动力学变化所致)。这也表明了传统PCR平台期测量时结果存在变异,产出的DNA量不一定能反映最初情况,所以无法进行定量。

荧光定量 PCR

同样在图3中,发现在指数期内,3个反应孔的扩增曲线完全重合,说明指数期内进行检测将更加精确,可实现更加准确的定量。阈值线是扩增产物荧光强度超过背景时的一个荧光强度值,样品达到此荧光强度值所经过的循环数称为Cq值。通过比较未知浓度的样品与一系列标准品的Cq值,可以精确测定未知反应中的模板 DNA数量。


数字 PCR

数字 PCR 是通过将样本DNA随机分布至独立的反应单元中,每个反应单元中包含或者不包含1个或多个拷贝的目标分子,所有独立的反应单元进行平行扩增后,对每个反应单元的阴性或者阳性荧光信号进行检测并进行统计学分析,就可以计算出原始样本的拷贝数,无需参考标准品或内源性对照品,也不需要标准曲线。

传统PCR 、荧光定量 PCR与数字 PCR的选择


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参考文献:

1. Sykes PJ, Neoh SH, Brisco MJ, Hughes E, Condon J, Morley AA. Quantitation of targets for PCR by use of limiting dilution. Biotechniques. 1992;13(3):444-449.

2. Vogelstein B , Kinzler K W . Digital PCR[J]. Proceedings of the National Academy of ences of the United States of America, 1999, 96(16):9236-9241.

3. Heyries KA, Tropini C, Vaninsberghe M, et al. Megapixel digital PCR. Nat Methods. 2011;8(8):649-651.

4. Dingle TC, Sedlak RH, Cook L, Jerome KR. Tolerance of droplet-digital PCR vs real-time quantitative PCR to inhibitory substances. Clin Chem. 2013;59(11):1670-1672.

5. Whale AS, Huggett JF, Cowen S, et al. Comparison of microfluidic digital PCR and conventional quantitative PCR for measuring copy number variation. Nucleic Acids Res. 2012;40(11):e82.


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适用于实时荧光定量PCR仪QS7 八联管pcr板

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VP1021-C半裙边96*0.1mlPCR板透明10块/盒,20盒/箱
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VP2001-C无裙边96*0.2mlPCR板透明10块/盒,20盒/箱
VP2031-C无裙边96*0.2ml凸PCR板透明10块/盒,20盒/箱
VP2011-C半裙边96*0.2mlPCR板透明10块/盒,20盒/箱
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适用仪器:

适用于罗氏Lightcycler480荧光定量PCR仪

用途:

广泛应用于遗传、生化、免疫、医药等领域,不仅应用于基因分离、克隆和核酸序列分析等基础研究,还可用于疾病的诊断或任何有DNA,RNA的地方,属于实验室一次性易耗品。

实验相关耗材:

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S-5103Tip 0.5-20ul进口加长吸嘴,无色, 带滤芯, 盒装灭菌,无DNA酶无RNA酶无热源

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S-5106Tip 1-200ul进口加长吸嘴,无色, 带滤芯, 盒装灭菌,无DNA酶无RNA酶无热源

S-5107SRTip 100-1300ul进口加长吸嘴,无色, 带滤芯, 盒装灭菌,无DNA酶无RNA酶无热源

BS-1778人α-酮异戊酸脱氢酶(α-KAD)ELISA试剂盒

BS-1779人支链氨基酸脱氢酶(BCAAD)ELISA试剂盒

BS-1780人uroguanylin(UGN)ELISA试剂盒

BS-1781人串珠素(HSPG2)ELISA试剂盒

BS-1782人淀粉样蛋白A1(SAA1)ELISA试剂盒

BS-1783人白介素29(IL-29)ELISA试剂盒

BS-1784人甲壳质酶蛋白40(YKL-40)ELISA试剂盒

T-200-Y-R-S200ul盒装灭菌黄吸头 96个/10盒/5彩盒/箱

T-350-C-R-S300ul盒装灭菌吸头 96支/10*5盒/箱

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TGL-200RD-57-R200ul盒装圆嘴上样吸头 200支/2盒/箱

TR-222-C-L-R-S200ul盒装灭菌低吸附带刻度吸头96*10*5盒

23-0005-ST0.5ml冻存管,自立,外旋盖,底部带二维码

23-0015-ST1.5ml冻存管,自立,外旋盖,底部带二维码

0.1-10ul 带滤芯超微吸头,盒装,无色,无菌,96/铰链盒,10盒/包装,5包装/箱

20-200ul 带滤芯吸头,有刻度,盒装,无色透明,无菌,96/铰链盒,10盒/包装,5包装/箱

4306737MicroAmp™ Optical 96-Well Reaction Plate with Barcode

4309849MicroAmp™ Optical 384-Well Reaction Plate with Barcode

适用于实时荧光定量PCR仪QS7 八联管pcr板

产品优势:本生生物代理实验室耗材,PCR耗材品种全,可替代仪器原厂耗材,性价比高,质量稳定,对用户可以节省实验成本。

2021-10-11 14:42:00 515 0
如何处理实时荧光定量PCR数据

实时荧光定量PCR数据中的基本概念:

在整个扩增过程中会出现基线期,指数期,线性期和平台期。其中在基线期和指数增长期,扩增产物都是以指数级增长,但是在基线期我们没办法检测;而到了线性期和平台期之后,由于不同基因,或者不同条件下其扩增效率差别很大,因此没有办法计算模板的含量。因此,在指数增长期的CT值就成了计算模板含量的关键值。

▲ 图一:线性图谱

▲ 图二:对数图谱

为什么知道CT值就能够得到最初的目标基因含量呢?

如图三,表示一个基因单次扩增曲线。N为扩增产物的分子数,模板的分子数乘以1+扩增效率的n次方,n代表循环次数。也就是说,如果扩增效率为100%,产物的分子数就等于模板数乘以2的n次方。但是在线性增长期和平台期,扩增效率不可能是100%,因此PCR理论方程只在指数期成立,也就是图三绿色框的部分。

▲ 图三

数据处理:

以下三张图分别表示我们在做荧光定量PCR时提到的三个名称:扩增曲线、标准曲线、溶解曲线。

1、juedui定量:使用一系列稀释的已知浓度的标准品与未知样本同时进行测定,根据系列浓度标准品的CT值与起始模板量之间的线性比例关系。

注意事项:

☑  标准品必须来源可靠,浓度已知。

☑  标准品要和待测样品同时在仪器中扩增。

☑  只能根据标准品覆盖的浓度范围进行待测样本浓度的推测。

2、相对定量:是用来确定经过不同处理的样品之间的表达差异或目标在不同时相差的表达差异,也就是倍数差异。


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