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QExactive一小时DDA鉴定DIA定量Hela 蛋白

本文由 赛默飞色谱及质谱 整理汇编

2018-08-10 10:58 318阅读次数

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数据非依赖性的扫描模式(data-independentacquisition,DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/定量。DIA扫描模式中,超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并快速地依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子。DIA的数据中包含了所有碎片离子的保留时间和强度信息。用非常小的质量偏差宽口(如10ppm)目标性地抽提同一肽段的多个子离子,计算子离子的强度,就能对该肽段进行鉴定和定量。DIA定量相比传统的基于母离子强度的DDA定量有选择性好,定量准确等优点[1],所以DIA成为定量蛋白组学新的发展方向。QExactiveHF是赛默飞世尔科技在2014年的ASMS上推出的全新静电场轨道阱超高分辨质谱仪(图1)[2,3]。QExactiveHF采用了分段式四极杆技术(AdvancedQuadrupoleTechnology,AQT)使离子传输效率至少提高了2倍;超高场Orbitrap技术,提高了Orbitrap扫描速度,在15000分辨率时,二级谱图的扫描速度是20Hz。这两项技术提高了QEHF进行DDA、DIA数据的采集能力。本文用1小时快速色谱梯度对QEHF的DDA鉴定能力和DIA定量能力进行考察,同时从定量肽段数目和CV两方面对DDA定量和DIA定量能力进行比较。使用仪器:QExactiveHF

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