新品前瞻｜突破800Hz极速边界！SCIEX新一代ZT Scan DIA全景质谱采集技术详解

ZT Scan DIA介绍

ZT Scan DIA采集方法

OS软件中已经内置了预设好的ZT Scan DIA采集方法，无需更多的设置和优化，根据实验目的和色谱半峰宽选择合适的方法即可。如图2所示，750-5方法适合更高的上样量和更高的通量，750-10方法适合低上样量和相对低的通量，375-7.5方法适合中低上样量和更低的通量。

ZT Scan DIA

在低上样量条件下

显著提升蛋白鉴定数和定量准确性

图3比较了在低上样量条件下，在微升和纳升系统下ZT Scan DIA相对于Zeno SWATH DIA性能的提升。

在微升流速下，K562样品上样5ng，ZT Scan DIA使用5min有效梯度情况下，蛋白鉴定数目提升超过20%，定量结果CV<20%和CV<10%蛋白数目提升超过25%，并且都要优于Zeno SWATH DIA的15min有效梯度。在纳升流速下的表现更加明显，K562样品上样0.5ng，ZT Scan DIA使用15min有效梯度下，蛋白鉴定数目提升超过50%，定量结果CV<20%蛋白数目提升超过60%，CV<10%蛋白数目提升超过100%，定量结果显著优于Zeno SWATH DIA的30min有效梯度。这些结果表明，ZT Scan DIA使用户能够从有限的样本量中得到更准确的定量结果。此外，在使用更短的液相色谱梯度时，ZT Scan DIA能够以低上样量提供与传统DIA方法相当或更好的蛋白质组学性能，使用户能够在更短的时间内获得有生物学意义的结果。

ZT Scan DIA

在高通量条件下

显著提升蛋白鉴定数和定量准确性

连接Evosep One液相，图4比较了在200、300和500SPD高通量条件下ZT Scan DIA相对于Zeno SWATH DIA性能的提升，可以看到蛋白和肽段的鉴定和定量数目都有明显的提升，蛋白鉴定数最高可以提升44%，定量结果CV<20%蛋白数目可以提升35%，肽段鉴定数最高可以提升54%，定量结果CV<20%肽段数目可以提升45%。

总体来看，在500SPD的超高通量下，ZT Scan DIA性能的提升水平最高，这突显了ZT Scan DIA针对高度复杂的样本，在短梯度条件下，在提高蛋白鉴定和定量结果方面的有效性。因此，ZT Scan DIA非常适合大队列复杂样本的高通量生物标志物研究。

ZT Scan DIA

提升蛋白覆盖度和降低假阳性率

图5比较了在两种不同混样中，ZT Scan DIA相对于Zeno SWATH DIA在蛋白覆盖度上的提升，可以看到，不但在蛋白和肽段的鉴定数上有提升，大多数蛋白覆盖度都有明显的提高，最高可以达到7倍。

这与之前的结果相一致，即ZT Scan DIA对于低丰度蛋白和肽段的检测有显著提升，从而提高了蛋白的覆盖度，而低丰度蛋白的检测在生物标志物的研究中通常更具有挑战性。图6比较了ZT Scan DIA和Zeno SWATH DIA蛋白鉴定结果的假阳性率，相比之下，ZT Scan DIA降低了假阳性率，这是由于增加了Q1扫描的维度，产生了更高质量和特异性的二级谱图，从而为蛋白质组学的研究提供更加可靠的结果。

参考文献：

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