
Amira/Avizo/PerGeos三维可视化与分析软件旨在解决您图像处理过程中的棘手问题!4月份云课堂又来啦!本期云课堂,我们很荣幸的邀请到三位经验丰富的专家为我们分享他们ZY的工作与科研心得。更针对性、更专业的讲解,让您的工作事半功倍!赶快扫描文中的二维码报名吧!
Thermo Scientific™Amira™/Avizo™ 软件是功能强大的三维可视化与分析软件,为生命科学及材料科学领域提供广泛的三维数据探索与解决办法。软件支持处理不同图像采集仪器获得的大量的多模态数据,包括光学和电子显微镜,CT,MRI等技术。Amira/Avizo 软件处理数据快速且灵活,支持先进的2D-5D生物成像工作流程,也为材料表征提供优化的工作流程。软件具有强大的图像处理工具、数字模拟以及先进的缺陷分析等功能。
PerGeos™是业界shou款数字岩心软件,能帮助地质学家快速分析数字岩石,以便勘探及生产工程师能够便捷地获取有意义且可操作的数据。通过分析岩石的静态和动态属性提高储层质量评价的可靠性。PerGeos软件能够处理、优化、三维展示和分析各种类型的数据(例如CT,显微镜等仪器获得的数据),为岩石和材料表征提供zui优化的工作流程。

报告摘要及主讲人简介
DY讲
基于Avizo的U-Net深度学习分割方法
摘要
神经网络的深度学习U-NetZ 早发布于MICCAI,其文章引用量已达10156次,足见其在人工智能领域超凡的影响力。为了便于使用者能够轻松便捷地使用,Avzio将原始U-Net进行聚合,开发出U-Net模块。本次报告将对Avizo中的U-Net模块进行系统讲解。并介绍本课题组基于U-Net模块在目标追踪,图像分割,目标识别等领域的研究工作。

主讲人:付天宇
国科学院高能物理研究所在读博士生,研究领域:x射线图像处理。在国内外学术刊物上发表学术论文三篇。
第二讲
平铺光片显微镜透明生物组织成像
技术及其用于解析生物智能的探索
摘要
Understand intelligence requires the understanding of the central nervous system neural network. The recent progresses made in tissue imaging through the combination of tissue clearing, tissue expansion, and light sheet microscopy suggest an opportunity to achieve the goal. Driven by this motivation, we developed a tiling light sheet microscope for rapid multicolor 3D imaging of cleared tissues. The microscope uses tunable tiling light sheets to achieve higher spatial resolution and better optical sectioning ability than conventional light sheet microscopes. It is capable to image cleared tissues with micron-scale to submicron-scale spatial resolution, and the resolving ability is improved to sub-hundred nanometers via tissue expansion. It is compatible with all tissue clearing methods and aligned semiautomatically through the phase modulation of the illumination light, which makes that microscope accurate, reliable, and easy to operate. We also developed a comprehensive solution to image whole mouse spinal cord at sub-micron spatial resolution and mouse spinal cord sections at sub-hundred nanometer spatial resolution. In addition, we report our observations on the mouse spinal cord neutral network structure and discuss how our solution can be used to facilitate the understanding of intelligence.

主讲人:高亮博士
分别于2000年和2003年获清华大学学士和硕士学位,2009年获美国Purdue大学博士学位。2010年至2013年间在Howard Hughes医学研究院,Janelia研究所,诺贝尔奖获得者Eric Betzig 博士实验室从事博士后研究。2014年至2016年间任美国纽约州立大学石溪分校助理教授。2017至2018年间任美国3I显微镜公司首席研究科学家。2019年全职加入西湖大学。
第三讲
利用Pergoes分析剩余油分布规律
及微观驱油机理
摘要
在油田开发过程中,剩余油的分布及微观赋存状态是研究油田采出程度的重要因素。本次讲座介绍利用高精度CT扫描技术获取岩心内部图像,并结合Pergeos软件进行图像处理和数据分析,识别岩心微观剩余油赋存状态,并对剩余油进行定性及定量表述,明确不同驱替阶段微观剩余油形态变化。

主讲人:史浩宇
新南威尔士大学硕士,ZG石油大学(华东)本科,现就职于数岩科技股份有限公司。主要从事储层物性,渗流机理和提高采收率研究等。熟悉多种数字岩芯实验(例如:CT扫描实验,扫描电镜实验,矿物质成份分析等)及数字岩芯处理软件(例如:Pergeos,Avizo, Icore等)。利用数值模拟技术分析储层岩石物性,擅长压汞模拟和多孔介质流动模拟等。
Avizo在页岩储层储集空间表征的简单应用
摘要
页岩油气已经成为我国非常规资源的开发ZD,其储层内部储集空间主要由微米级层理缝与微纳米级孔喉系统所构成。页岩储层微观结构的表征对于揭示储层内部结构至关重要。本次讲座主要介绍Avizo和PerGeos软件在页岩微纳米级储集空间表征中的应用。

主讲人:马克
ZG石油大学(北京)博士,就职于数岩科技股份有限公司,主要从事非常规油气储层开发地质相关研究。利用数字岩心系列实验方法,系统性揭示了混合沉积成因的非常规油气储层孔喉系统演化。作为ZT组研究骨干参加国家973基础研究计划1项,参编专著1部,在石油地质领域发表文章十余篇。
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何丹宇,esther.he@thermofisher.com
158-0131-0649
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