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Carrier RNA常见类型、作用原理及优缺点介绍

来源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新时间:2024-12-25 14:21:08 阅读量:76

1. Carrier RNA概念及作用

荧光定量PCR是分子诊断主流技术,包括核酸提取和PCR扩增两个环节,两者共同决定了该检测方法的评测参数。以最直观最关键的检测灵敏度指标来看,只有实现了提取环节最优化和PCR扩增环节最优化的情况下,检测灵敏度的结果才更可信。检测灵敏度显示了检测试剂的检测下限,对于荧光定量PCR而言,即一定样本浓度下的病毒核酸检出率。

 

Carrier RNA,中文名载体RNA,又叫核酸助沉剂。在核酸提取环节,提取使用到的离心管壁多是聚丙烯的材料,管壁上有静电,会吸附核酸。在提取纯化过程中采用Carrier RNA 可帮助核酸去除静电效应,保证核酸能很好被吸附到纯化柱上,提高洗脱效率,从而达到尽可能多的回收样本中核酸!
 

2. Carrier RNA常见类型

作为核酸沉淀的辅助物质,Carrier RNA有多种类型。

类型

代表物质

作用原理

多聚糖

糖原

RNA在高盐、无水乙醇环境中溶解度很低,通过高速离心可发生沉淀。当RNA浓度很低时,微量RNA不足以形成沉淀。在上述环境条件下,糖原也不可溶并可与RNA共沉淀,形成可视化沉淀。

核酸混合物

PolyA钾盐、大肠杆菌总RNA、酵母总RNA、tRNA等

减少吸附损失,降低核酸酶攻击待提取核酸的概率。

其他

线性化丙烯酰胺

减少吸附损失


3. 产品介绍——上海翌圣生物生产的Carrier RNA

翌圣生物Carrier RNA是酵母来源的RNA,无DNase、RNase酶残留,蛋白和DNA残留含量极低。可用于病毒核酸提取、微量DNA提取等实验,提取的核酸可用于后续RT-PCR,RT-qPCR等实验。产品分为液体和冻干型粉末制剂,便于直接使用和长距离运输、保存。

产品名称

产品编号

规格

保存条件

Carrier RNA, 6 μg/μL

19701ES03

1 mL

-20℃保存,可保存2年

Carrier RNA Powder, 216 μg/tube

19703ES01

1 tube

室温保存,可保存1年

Carrier RNA Powder, 310 μg/tube

19704ES01

1 tube

室温保存,可保存1年

 

本品为核酸混合物,产品使用非常简单,在纯化核酸过程中通过添加微克量(μg)的Carrier RNA,即可实现提升低至皮克级别(pg)微量核酸的沉淀效率,达到提升试剂检测灵敏度的目的。

其作用原理主要是通过混入大量核酸(Carrier RNA),减少了目标核酸物质的管壁吸附损失,进而提高微量的核酸纯化柱上的结合和洗脱效率,同时降低了提取环境中的RNase降解微量RNA的概率。


4. 应用案例

● Carrier RNA的加入有助于低丰度SARS-CoV-2假病毒核酸检测

使用磁珠法拭子样本病毒DNA/RNA提取试剂盒,提取不同浓度的SARS-CoV-2假病毒样本核酸,后续使用新 冠检测试剂盒进行检测N基因。结果显示,添加Carrier RNA后,具有更高的提取效率,使下游检测更灵敏。

Ct值

0 copies/mL

125 copies/mL

250 copies/mL

500 copies/mL

1000 copies/mL

NTC

不加carrier RNA

N/A; N/A; N/A

N/A; N/A; N/A

N/A; 40.4; N/A

N/A; 40.16; 40.88

38.05; 38.02

N/A; N/A; N/A

加carrier RNA

N/A; N/A; N/A

N/A; 40.54; N/A

40.2; 40.29; 38.95

38.61; 39.03; 38.59

37.53; 36.34

 

 

图片.png

见图1-1

● Carrier RNA放置于65℃不同时间(3d,6d,9d)后,与提取性能标准保存条件一致

Carrier RNA粉末分别放置于65℃ 3d,6d,9d进行加速试验测试,测试方案为:使用磁珠法拭子样本病毒DNA/RNA提取试剂盒,提取不同浓度的SARS-CoV-2假病毒样本核酸,后续使用新 冠检测试剂盒进行检测orf1abN基因。结果显示,与标准保存条件(-20℃)相比,置于65℃保存9天的Carrier RNA,性能不发生变化。

VIC:

Ct值

0 copies/mL

250 copies/mL

500 copies/mL

1000 copies/mL

2000 copies/mL

NTC

65℃ 3天

 

36.32; 36.03; 36.26

35.16; 35.41; 39.26

35.19; 36.58; 35.44

33.80; 33.55

 

65℃ 6天

 

36.28; 35.61; 35.42 

36.40; 35.21; 35.23

35.29; 34.37; 34.09

33.91; 33.21

 

65℃ 9天

 

36.40; 35.53; 37.41

36.24; 36.07; 36.63

34.34; 34.21; 34.25

33.97; 33.54

 

-20℃保存

N/A; 39.47; 39.86

36.40; 36.41; 38.01

35.55; 35.48; 36.01

33.14; 34.51; 34.50

33.92; 33.00

N/A; 40.15; 39.39

FAM:

Ct值

0 copies/mL

250 copies/mL

500 copies/mL

1000 copies/mL

2000 copies/mL

NTC

65℃ 3天

 

36.88; 37.07; 36.34

35.21; 35.62; 40.02

35.32; 36.61; 35.49

34.13; 33.86

 

65℃ 6天

 

35.98; 35.68; 35.32

37.34; 35.56; 35.39

35.69; 34.53; 34.14

34.35; 33.47

 

65℃ 9天

 

36.29; 36.20; 37.63

36.60; 35.86; 36.31

34.83; 34.41; 34.61

34.00; 33.58

 

-20℃保存

N/A; N/A; N/A

36.06; 36.27; 39.08

35.63; 36.04; 37.43

33.5; 35.11; 34.49

34.09; 33.09

N/A; N/A; N/A

图片.png
图片.png

见图2-1、图2-2

 

● 翌圣Carrier RNA V.S. Q同类产品

使用磁珠法拭子样本病毒DNA/RNA提取试剂盒,提取不同浓度的SARS-CoV-2假病毒样本核酸,后续使用新 冠检测试剂盒进行检测N基因。结果显示,添加Carrier RNA后,具有更高的提取效率,使下游检测更灵敏。 

VIC:

Ct值

0 copies/mL

125 copies/mL

250 copies/mL

500 copies/mL

1000 copies/mL

NTC

YEASEN

N/A; N/A; N/A

N/A; N/A; N/A

38.76; 38.47; 39.53

38.83; 37.60; 37.82

37.91; 37.17

N/A; N/A; N/A

Q品牌

N/A; N/A; N/A

N/A; 40.01; N/A

N/A; 39.57; N/A

37.42; 39.06; 38.85

N/A; 36.04

 

FAM:

Ct值

0 copies/mL

125 copies/mL

250 copies/mL

500 copies/mL

1000 copies/mL

NTC

YEASEN

N/A; N/A; N/A

N/A; N/A; 38.06

38.92; 37.44; N/A

35.71; 38.51; 36.36

35.31; 34.59

N/A; N/A; N/A

Q品牌

N/A; N/A; N/A

N/A; 38.85; N/A

38.61; 36.75; 39.58

37.41; 36.43; 35.70

36.25; 35.79

 

图片.png图片.png

见图3-1、图3-2


5、相关产品
 

Carrier RNA提供成管冻干粉及液体类型,可直接用于各类应用场景。

产品名称

产品编号

规格

价格(元)

Carrier RNA, 6 μg/μL

19701ES03

1 mL

635.00

Carrier RNA, 6 μg/μL

19701ES08

5 mL

询价

Carrier RNA Powder, 216 μg/tube

19703ES01

1 tube

75.00

Carrier RNA Powder, 216 μg/tube

19703ES80

100 tube

询价

Carrier RNA Powder, 216 μg/tube

19703ES92

1000 tube

询价

Carrier RNA Powder, 310 μg/tube

19704ES01

1 tube

95.00

Carrier RNA Powder, 310 μg/tube

19704ES80

100 tube

询价

Carrier RNA Powder, 310 μg/tube

19704ES92

1000 tube

询价

 

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翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。

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