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干货 | 限制性内切酶知多少?

来源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 更新时间:2024-12-25 14:25:13 阅读量:129

 

何谓限制性内切酶?

 

限制性内切酶是一种能够识别双链DNA分子中特定核苷酸序列,并在特定位置切割DNA链中的磷酸二酯键的一类酶,简称限制酶。

不同的限制性内切酶会识别不同的DNA序列,它可以在识别序列内或距识别序列不远的位置处切割DNA,酶切之后会形成不同类型的产物,如下图中的BamHI形成5’粘性末端产物,KpnI形成3’粘性末端产物,EcoRV形成平末端产物。

 

1213.jpg

▲ BamHI、KpnI、EcoRV酶切示意图

 

众所周知,限制性内切酶最常用于分子克隆实验中。但除了克隆,它还可以应用于疫苗研发生产、基因测序、SNP鉴定、ddPCR等领域。

 

限制性内切酶的命名规则

 
限制性内切酶的命名主要是根据细菌的属名、种名、菌株或血清型、发现的顺序而定,以BstEII为例,命名规则如下表所示:
表1:限制性内切酶的命名规则
 

缩写

全名

含义

B

Bacillus

属名第一个字母

st

stearothermophilus

种名前两个字母

E

ET

株系名第一个字母

II

第二个发现

在此类细菌中发现的顺序

 

限制性内切酶的分类

 

 

根据结构的复杂程度、作用方式与辅因子的区别,限制性内切酶可分为四大类,以下内容总结了各类的特点和典型酶种:

 

1

Type Ⅰ

特点

1.同时具有识别切割和修饰活性;
2.能够识别DNA特定序列,切割位点距离识别位点不定,可达数千个碱基之远;
3.作用时需要ATP。

典型酶种:EcoB、Ecok等

2

Type Ⅱ

特点

1.只具有识别切割的作用;
2.识别序列多为短的回文序列(一般为4-8bp),酶切位点通常就是所识别序列,特异性切割;
3.作用时需要Mg
2+
4.分子克隆中最常用的一类限制酶。

典型酶种:HindII、NotI等

3

Type Ⅲ

特点

1.同时具有识别切割和修饰活性;
2.切割位点大约距离识别位点24-26bp;
3.作用时需要ATP。

典型酶种:Hinflll等

4

Type Ⅳ

特点

1.仅切割被甲基化修饰了的DNA序列;
2.切割位点距离识别位点 30 bp左右。

典型酶种:MrcA、McrBC等

除了以上分类,根据识别和切割位点的异同可以分为3类,如下表所示:

表2:同裂酶、异列酶和同尾酶对比

内切酶类别

特点

典型酶种

Type I

1、同时具有识别切割和修饰活性;

2、能够识别DNA特定序列,切割位点距离识别位点不定,可达数千个碱基之远;

3、作用时需要ATP。

EcoB、EcoK等

Type II

1、只具有识别切割的作用;

2、识别序列多为短的回文序列(一般为4-8bp),酶切位点通常就是所识别序列,特异性切割;

3、作用时需要Mg2+

4、分子克隆中最常用的一类限制酶。

HindIII,NotI等

Type III

1、同时具有识别切割和修饰活性;

2、切割位点大约距离识别位点24-26bp;

3、作用时需要ATP。

HinfIII等

Type IV

1、仅切割被甲基化修饰了的DNA序列;

2、切割位点大约距离识别位点 30 bp左右。

McrA,McrBC等

 

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限制性内切酶.png

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翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。

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